More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1942 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  45.68 
 
 		 1014 aa  875    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  40.22 
 
 		 1049 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  51.95 
 
 		 1021 aa  1028    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  39.16 
 
 		 1030 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  46.24 
 
 		 1017 aa  885    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.85 
 
 		 1017 aa  1031    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  78.6 
 
 		 1039 aa  1649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  40.33 
 
 		 1040 aa  784    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 		 1019 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  46.23 
 
 		 1041 aa  869    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  40.47 
 
 		 1012 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  45.41 
 
 		 1024 aa  880    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  38.68 
 
 		 1020 aa  751    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0808  RND family mulitdrug efflux protein  42.62 
 
 		 1037 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485603  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.48 
 
 		 1036 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.71 
 
 		 1011 aa  832    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.73 
 
 		 1033 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.91 
 
 		 1056 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  62.97 
 
 		 1047 aa  1320    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  45.63 
 
 		 1033 aa  882    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1039 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  43.71 
 
 		 1012 aa  844    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1047 aa  1001    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  44.2 
 
 		 1021 aa  847    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  85.71 
 
 		 1036 aa  1793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5639  acriflavin resistance protein  39.63 
 
 		 1047 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  51.52 
 
 		 1022 aa  1009    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  46.33 
 
 		 1017 aa  889    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51 
 
 		 1056 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  45.75 
 
 		 1017 aa  870    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  52.24 
 
 		 1022 aa  1020    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1029 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  40.33 
 
 		 1046 aa  767    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  50.77 
 
 		 1048 aa  994    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  44.64 
 
 		 1035 aa  838    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  40.58 
 
 		 1045 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  44.09 
 
 		 1020 aa  859    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1054 aa  962    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1703  acriflavin resistance protein  41.88 
 
 		 1021 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1024 aa  1034    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.05 
 
 		 1057 aa  978    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  45.93 
 
 		 1018 aa  877    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  46.69 
 
 		 1046 aa  929    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  38.97 
 
 		 1030 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  44.79 
 
 		 1015 aa  861    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  62.43 
 
 		 1060 aa  1294    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  49.27 
 
 		 1050 aa  994    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  47.44 
 
 		 1046 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  47.07 
 
 		 1059 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  50.19 
 
 		 1067 aa  1002    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1012 aa  653    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  61.9 
 
 		 1089 aa  1292    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3446  acriflavin resistance protein  39.46 
 
 		 1024 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  51.06 
 
 		 1045 aa  989    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  61.94 
 
 		 1067 aa  1288    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  44.59 
 
 		 1110 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  43.88 
 
 		 1044 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1056 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 		 1018 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  46.17 
 
 		 1046 aa  922    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1044 aa  959    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  62.86 
 
 		 1049 aa  1282    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1036 aa  2086    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  51.16 
 
 		 1047 aa  990    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  40.33 
 
 		 1046 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  51.06 
 
 		 1049 aa  995    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  46.05 
 
 		 1020 aa  888    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1037 aa  831    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1031 aa  783    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 		 1017 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  45.77 
 
 		 1025 aa  886    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1031 aa  870    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1029 aa  757    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5653  acriflavin resistance protein  39.83 
 
 		 1022 aa  737    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235963  hitchhiker  0.00278387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  51.06 
 
 		 1050 aa  992    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  47.87 
 
 		 1046 aa  966    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  46.33 
 
 		 1031 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  40.76 
 
 		 1011 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2561  acriflavin resistance protein  39.2 
 
 		 1038 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.224795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.91 
 
 		 1056 aa  973    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  46.49 
 
 		 1021 aa  898    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1029 aa  754    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  64.17 
 
 		 1041 aa  1330    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  51.75 
 
 		 1021 aa  1023    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 		 1053 aa  975    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  52.52 
 
 		 1025 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  51.06 
 
 		 1047 aa  988    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  40.39 
 
 		 1045 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  44.69 
 
 		 1015 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  51.94 
 
 		 1025 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.42 
 
 		 1029 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  51.06 
 
 		 1049 aa  995    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  40.33 
 
 		 1046 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  61.14 
 
 		 1071 aa  1273    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  45.41 
 
 		 1024 aa  879    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  51.95 
 
 		 1021 aa  1027    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  60.89 
 
 		 1071 aa  1244    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  51.85 
 
 		 1021 aa  1014    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  51.06 
 
 		 1048 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51 
 
 		 1056 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>