More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2777 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  40.63 
 
 		 1025 aa  774    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1029 aa  781    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  42.22 
 
 		 1019 aa  826    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.65 
 
 		 1016 aa  768    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.11 
 
 		 1028 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 		 1028 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.02 
 
 		 1028 aa  768    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  42.75 
 
 		 1017 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  41.69 
 
 		 1025 aa  800    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1029 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  41.23 
 
 		 1029 aa  782    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  42.74 
 
 		 1036 aa  812    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1021 aa  801    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  43.44 
 
 		 1036 aa  825    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.51 
 
 		 1010 aa  846    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1019 aa  798    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  41.7 
 
 		 1041 aa  766    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1014 aa  2026    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  41.01 
 
 		 1016 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1029 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  40.38 
 
 		 1015 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  42.98 
 
 		 1028 aa  830    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  42.24 
 
 		 1023 aa  817    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1024 aa  828    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  45.79 
 
 		 1016 aa  869    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 		 1028 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  40.54 
 
 		 1013 aa  752    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1024 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.8 
 
 		 1014 aa  724    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  42.39 
 
 		 1027 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1020 aa  786    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.5 
 
 		 1013 aa  866    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  42.14 
 
 		 1025 aa  813    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.01 
 
 		 1028 aa  822    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  42.63 
 
 		 1029 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  42.54 
 
 		 1029 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.48 
 
 		 1032 aa  807    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1013 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  42.07 
 
 		 1040 aa  801    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1021 aa  783    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  47.65 
 
 		 1043 aa  912    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1017 aa  745    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  41.93 
 
 		 1019 aa  823    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1056 aa  780    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1029 aa  790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  42.6 
 
 		 1009 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  42.5 
 
 		 1027 aa  795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  38.28 
 
 		 1012 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  34.45 
 
 		 1020 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  34.68 
 
 		 1027 aa  612  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1035 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1035 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  35.65 
 
 		 1019 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1035 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  33.46 
 
 		 1022 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1067 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1046 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1071 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.04 
 
 		 1027 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1041 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.85 
 
 		 1046 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  34.17 
 
 		 1025 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1044 aa  546  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1019 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  32.6 
 
 		 1040 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1018 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1089 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1018 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.14 
 
 		 1041 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1039 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1053 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1022 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1047 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1051 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.58 
 
 		 1036 aa  532  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1046 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1045 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1039 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.84 
 
 		 1017 aa  529  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1036 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1051 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1054 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1056 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.03 
 
 		 1036 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1023 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.87 
 
 		 1019 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1049 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1035 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1049 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1073 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1057 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1021 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.78 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1059 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1035 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1050 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1060 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1046 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>