More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2116 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  62.54 
 
 		 1020 aa  1295    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.55 
 
 		 1016 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  35.14 
 
 		 1019 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 		 1013 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  36.12 
 
 		 1021 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.05 
 
 		 1010 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1019 aa  673    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  36.79 
 
 		 1036 aa  663    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1019 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  99.9 
 
 		 1035 aa  2107    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1035 aa  2108    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.25 
 
 		 1013 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37 
 
 		 1032 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  63.15 
 
 		 1027 aa  1344    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1036 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  36.38 
 
 		 1025 aa  656    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  94.77 
 
 		 1035 aa  1970    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.24 
 
 		 1028 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  36.89 
 
 		 1025 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1023 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1028 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1009 aa  625  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1024 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1017 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1056 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  34.15 
 
 		 1025 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1020 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1028 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1024 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.97 
 
 		 1014 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 		 1041 aa  602  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1029 aa  602  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1029 aa  602  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  33.4 
 
 		 1015 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  34.25 
 
 		 1016 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 		 1021 aa  599  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1040 aa  595  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  35.2 
 
 		 1029 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1027 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1012 aa  592  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1029 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1029 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1029 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1027 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1029 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  35.35 
 
 		 1017 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1014 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.93 
 
 		 1028 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1028 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.83 
 
 		 1028 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1016 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.84 
 
 		 1013 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 		 1043 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 		 1067 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1019 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1049 aa  525  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1073 aa  522  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1046 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1089 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1016 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1040 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1046 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1067 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.33 
 
 		 1017 aa  512  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1047 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1036 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1050 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1048 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1021 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.55 
 
 		 1036 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.96 
 
 		 1056 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  30.82 
 
 		 1041 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.86 
 
 		 1056 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.83 
 
 		 1027 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1048 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.96 
 
 		 1056 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.96 
 
 		 1056 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  31.51 
 
 		 1025 aa  509  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1018 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  30.09 
 
 		 1015 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1024 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1046 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1044 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1022 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1051 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1021 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1048 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1054 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1022 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1071 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.37 
 
 		 1025 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1060 aa  506  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1049 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.86 
 
 		 1046 aa  506  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1047 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  29.99 
 
 		 1015 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1049 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  29.7 
 
 		 1022 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1017 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>