More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0550 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  74.95 
 
 		 1028 aa  1577    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  48.52 
 
 		 1020 aa  989    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  56.12 
 
 		 1021 aa  1147    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  53.24 
 
 		 1025 aa  1124    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  53.03 
 
 		 1019 aa  1090    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  54.54 
 
 		 1036 aa  1124    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.48 
 
 		 1016 aa  842    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  74.56 
 
 		 1028 aa  1545    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.96 
 
 		 1027 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  52.79 
 
 		 1019 aa  1092    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 		 1028 aa  965    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  54.04 
 
 		 1036 aa  1112    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.93 
 
 		 1028 aa  965    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  38.34 
 
 		 1020 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.09 
 
 		 1010 aa  962    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  42.66 
 
 		 1019 aa  856    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  75.25 
 
 		 1025 aa  1555    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.48 
 
 		 1014 aa  762    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  40.22 
 
 		 1012 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  48.97 
 
 		 1041 aa  980    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  52.11 
 
 		 1023 aa  1073    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.46 
 
 		 1028 aa  1106    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.3 
 
 		 1013 aa  799    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1867    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.61 
 
 		 1016 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.83 
 
 		 1028 aa  962    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  53.7 
 
 		 1024 aa  1102    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  74.39 
 
 		 1024 aa  1519    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1869    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  41.77 
 
 		 1040 aa  850    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  45.68 
 
 		 1009 aa  878    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1056 aa  900    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.92 
 
 		 1032 aa  1101    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  99.81 
 
 		 1029 aa  2074    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2079    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.67 
 
 		 1013 aa  767    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  42.44 
 
 		 1014 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  43.3 
 
 		 1013 aa  822    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  84.99 
 
 		 1021 aa  1737    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  91.84 
 
 		 1027 aa  1856    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1029 aa  1035    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  44.25 
 
 		 1043 aa  825    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  52.01 
 
 		 1025 aa  1033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.52 
 
 		 1017 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1867    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1017 aa  823    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  53.48 
 
 		 1015 aa  1070    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  50.95 
 
 		 1016 aa  1000    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  96.68 
 
 		 1027 aa  1941    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1035 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1035 aa  625  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.01 
 
 		 1035 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1019 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1051 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.94 
 
 		 1025 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.33 
 
 		 1039 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1036 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1039 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.16 
 
 		 1027 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1039 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1048 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1048 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.89 
 
 		 1041 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.91 
 
 		 1019 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1047 aa  552  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1054 aa  552  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1049 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1049 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1050 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1018 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.46 
 
 		 1045 aa  549  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1036 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1022 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1053 aa  549  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1047 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1047 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1060 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1089 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1067 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1031 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1040 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1019 aa  542  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1048 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.23 
 
 		 1056 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.57 
 
 		 1022 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.23 
 
 		 1056 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.23 
 
 		 1056 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1046 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1046 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1042 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1016 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.13 
 
 		 1056 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.2 
 
 		 1057 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1049 aa  536  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1057 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1018 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>