More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1917 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  37.14 
 
 		 1013 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.11 
 
 		 1032 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.7 
 
 		 1016 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.95 
 
 		 1010 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1019 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  36.09 
 
 		 1025 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1021 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  63.44 
 
 		 1027 aa  1345    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  94.87 
 
 		 1035 aa  1992    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  94.77 
 
 		 1035 aa  1991    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  40.95 
 
 		 1013 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  36.69 
 
 		 1036 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  35.43 
 
 		 1019 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1019 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  63.5 
 
 		 1020 aa  1306    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  36.99 
 
 		 1036 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1035 aa  2112    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.95 
 
 		 1028 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  35.76 
 
 		 1023 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1024 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  37.08 
 
 		 1028 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 		 1025 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1009 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  36.37 
 
 		 1020 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  36.2 
 
 		 1028 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1056 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1017 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  34.39 
 
 		 1015 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.87 
 
 		 1014 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1024 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1041 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  36.11 
 
 		 1029 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  33.89 
 
 		 1025 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1016 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1012 aa  594  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  36.01 
 
 		 1029 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1040 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1021 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  35.88 
 
 		 1027 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 		 1029 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 		 1029 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1029 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1029 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 		 1027 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  34.76 
 
 		 1029 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  34.93 
 
 		 1017 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1014 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  36.13 
 
 		 1028 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.13 
 
 		 1028 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.03 
 
 		 1028 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1016 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1043 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1067 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.65 
 
 		 1013 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1049 aa  535  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1049 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1019 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1046 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.91 
 
 		 1025 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1073 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1024 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1067 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1021 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1022 aa  516  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1021 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.71 
 
 		 1017 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  31.51 
 
 		 1025 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1089 aa  512  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  31.49 
 
 		 1025 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.23 
 
 		 1027 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1036 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1022 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1046 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.45 
 
 		 1041 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1021 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1016 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1021 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  30.39 
 
 		 1022 aa  505  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.02 
 
 		 1056 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1071 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1048 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.02 
 
 		 1056 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1054 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1046 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1047 aa  506  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1047 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.92 
 
 		 1056 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.82 
 
 		 1033 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.02 
 
 		 1056 aa  503  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1033 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.75 
 
 		 1036 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  29.99 
 
 		 1015 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1014 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1044 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1017 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1048 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1048 aa  499  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>