More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3213 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  35.52 
 
 		 1019 aa  670    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 		 1017 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1019 aa  667    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1021 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  36.67 
 
 		 1013 aa  651    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.55 
 
 		 1010 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 		 1019 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  36.48 
 
 		 1025 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.33 
 
 		 1016 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1040 aa  642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.54 
 
 		 1028 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.55 
 
 		 1032 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1036 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 		 1023 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  70.41 
 
 		 1020 aa  1470    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 		 1024 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  63.15 
 
 		 1035 aa  1344    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  63.15 
 
 		 1035 aa  1345    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1013 aa  817    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1028 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1056 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  36.71 
 
 		 1036 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  100 
 
 		 1027 aa  2086    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  36.67 
 
 		 1025 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  63.44 
 
 		 1035 aa  1330    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  38.17 
 
 		 1009 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  33.93 
 
 		 1015 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1017 aa  635  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1029 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1029 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  36.11 
 
 		 1024 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1029 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1029 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1027 aa  625  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 		 1016 aa  619  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 		 1029 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 		 1029 aa  622  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.85 
 
 		 1014 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1021 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  34.9 
 
 		 1025 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1041 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1029 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  36.36 
 
 		 1027 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 		 1012 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1028 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1014 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1043 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1020 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1016 aa  582  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.23 
 
 		 1013 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1073 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1028 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.49 
 
 		 1028 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1014 aa  555  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.39 
 
 		 1028 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1019 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.59 
 
 		 1022 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1049 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1049 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1036 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1024 aa  539  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1089 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.01 
 
 		 1046 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1053 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.78 
 
 		 1041 aa  535  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.49 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.39 
 
 		 1025 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.59 
 
 		 1017 aa  529  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  30.61 
 
 		 1040 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1016 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1047 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1018 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1051 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1067 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.99 
 
 		 1039 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  31.84 
 
 		 1025 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  30.27 
 
 		 1025 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1040 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.84 
 
 		 1036 aa  526  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1039 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1071 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1042 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.41 
 
 		 1036 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1056 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1056 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1046 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1046 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1067 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1046 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1046 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1046 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1056 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1050 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.36 
 
 		 1056 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>