More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3665 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.29 
 
 		 1028 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  51.91 
 
 		 1019 aa  1091    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1056 aa  812    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.68 
 
 		 1013 aa  813    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  56.32 
 
 		 1025 aa  1174    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  52.34 
 
 		 1027 aa  1020    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  52.44 
 
 		 1029 aa  1035    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  47.29 
 
 		 1028 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1029 aa  1038    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  56.62 
 
 		 1036 aa  1173    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  52.6 
 
 		 1019 aa  1094    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.7 
 
 		 1010 aa  964    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  52.44 
 
 		 1029 aa  1038    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  45.13 
 
 		 1019 aa  885    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.14 
 
 		 1014 aa  793    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  55.53 
 
 		 1021 aa  1144    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  47.3 
 
 		 1015 aa  977    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  52.68 
 
 		 1028 aa  1051    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.92 
 
 		 1017 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.07 
 
 		 1014 aa  797    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.19 
 
 		 1028 aa  890    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  42.1 
 
 		 1013 aa  784    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  47.74 
 
 		 1041 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.22 
 
 		 1016 aa  853    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  53.2 
 
 		 1023 aa  1093    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  41.83 
 
 		 1017 aa  796    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  47.41 
 
 		 1016 aa  952    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.23 
 
 		 1016 aa  790    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  56.33 
 
 		 1036 aa  1172    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  51.42 
 
 		 1024 aa  1055    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1040 aa  857    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  51.95 
 
 		 1024 aa  1042    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  52.73 
 
 		 1029 aa  1022    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1029 aa  1020    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  53.55 
 
 		 1025 aa  1069    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  38.88 
 
 		 1013 aa  747    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  51.27 
 
 		 1021 aa  1030    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  52.44 
 
 		 1029 aa  1033    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1020 aa  916    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2089    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1043 aa  839    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  51.94 
 
 		 1028 aa  1066    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  48.97 
 
 		 1025 aa  980    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  55.45 
 
 		 1032 aa  1149    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  52.97 
 
 		 1027 aa  1024    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  43.88 
 
 		 1009 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.55 
 
 		 1028 aa  1128    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  34.98 
 
 		 1027 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1012 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.12 
 
 		 1020 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1035 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1035 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.88 
 
 		 1019 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 		 1036 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.11 
 
 		 1039 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1039 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  34.76 
 
 		 1035 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1073 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1039 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  32.95 
 
 		 1025 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1044 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1051 aa  571  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1060 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1067 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1089 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1053 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1067 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1046 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1049 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.84 
 
 		 1046 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1050 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1071 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1049 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1040 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1053 aa  557  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1036 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1024 aa  559  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1057 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1048 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1019 aa  555  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1023 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.25 
 
 		 1025 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1046 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1047 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1047 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1041 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1045 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1041 aa  549  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1023 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1042 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.27 
 
 		 1041 aa  546  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1054 aa  546  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.43 
 
 		 1045 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  31.05 
 
 		 1025 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1029 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1046 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1048 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1021 aa  539  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1049 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>