More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0057 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  41.75 
 
 		 1017 aa  799    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.82 
 
 		 1028 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  42.91 
 
 		 1029 aa  834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  42.7 
 
 		 1027 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  46.58 
 
 		 1025 aa  915    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  43.54 
 
 		 1027 aa  830    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.66 
 
 		 1014 aa  796    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.1 
 
 		 1016 aa  848    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  43.3 
 
 		 1029 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  43.09 
 
 		 1040 aa  879    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  44.9 
 
 		 1019 aa  913    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  42.15 
 
 		 1025 aa  829    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  45.64 
 
 		 1021 aa  899    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1017 aa  824    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.92 
 
 		 1028 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  45.13 
 
 		 1029 aa  862    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.57 
 
 		 1013 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  46.14 
 
 		 1036 aa  913    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1035 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 		 1012 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.92 
 
 		 1010 aa  987    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1019 aa  2058    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  42.1 
 
 		 1025 aa  824    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.34 
 
 		 1014 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  41.92 
 
 		 1028 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1013 aa  863    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1029 aa  833    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  41.22 
 
 		 1015 aa  801    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  42.01 
 
 		 1023 aa  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.93 
 
 		 1020 aa  668    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1029 aa  834    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  43.33 
 
 		 1028 aa  859    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.84 
 
 		 1016 aa  777    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1028 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  42.83 
 
 		 1024 aa  853    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.04 
 
 		 1028 aa  877    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  37.85 
 
 		 1027 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  37.38 
 
 		 1035 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1016 aa  759    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  42.66 
 
 		 1029 aa  825    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  42.66 
 
 		 1029 aa  824    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.5 
 
 		 1032 aa  901    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1035 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  39.9 
 
 		 1013 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 		 1009 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1019 aa  898    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1021 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  43.33 
 
 		 1024 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  41.05 
 
 		 1020 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  41.29 
 
 		 1043 aa  779    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  46.32 
 
 		 1056 aa  903    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  42.34 
 
 		 1041 aa  809    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  46.53 
 
 		 1036 aa  921    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1036 aa  619  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1051 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1036 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1049 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1049 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1019 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.73 
 
 		 1039 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1039 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1089 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1071 aa  598  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1039 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  34.43 
 
 		 1025 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.88 
 
 		 1041 aa  592  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1050 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1047 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1060 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1041 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.57 
 
 		 1046 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1044 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1046 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1024 aa  571  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1046 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 1031 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.8 
 
 		 1025 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1053 aa  566  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1051 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1073 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1046 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1021 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1029 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1021 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1040 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.86 
 
 		 1017 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1021 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1022 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1048 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1047 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  31.51 
 
 		 1025 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1021 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.01 
 
 		 1019 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1019 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1067 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1045 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1071 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.11 
 
 		 1027 aa  556  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>