More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2427 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 
1012 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.79 
 
 
1027 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.24 
 
 
1019 aa  810    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1019 aa  2069    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  43.15 
 
 
1025 aa  805    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.02 
 
 
1010 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 
1019 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  35 
 
 
1036 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 
1022 aa  718    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 
1021 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.41 
 
 
1032 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  35.22 
 
 
1036 aa  628  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
1009 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 
1039 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  33.76 
 
 
1025 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 
1039 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  33.6 
 
 
1039 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 
1019 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  36.08 
 
 
1067 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 
1031 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  35.19 
 
 
1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 
1029 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 
1029 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 
1013 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 
1029 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  35.26 
 
 
1041 aa  602  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 
1027 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  33.23 
 
 
1023 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  33.56 
 
 
1019 aa  598  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 
1024 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 
1029 aa  599  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.89 
 
 
1028 aa  598  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.07 
 
 
1016 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  33.5 
 
 
1024 aa  595  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 
1028 aa  595  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 
1036 aa  595  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  33.6 
 
 
1024 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 
1013 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1033 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  33.5 
 
 
1025 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 
1056 aa  591  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 
1023 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 
1053 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1036 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  32.97 
 
 
1019 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 
1029 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 
1029 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 
1067 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 
1027 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 
1050 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.65 
 
 
1033 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1012 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  35.65 
 
 
1014 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 
1040 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1040 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 
1027 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  33 
 
 
1016 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 
1021 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1047 aa  581  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1017 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.88 
 
 
1056 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 
1018 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 
1047 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.88 
 
 
1056 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1046 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.88 
 
 
1056 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1023 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 
1042 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1046 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 
1031 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.78 
 
 
1056 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  34.6 
 
 
1025 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1048 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 
1024 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.84 
 
 
1057 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 
1020 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 
1018 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 
1020 aa  575  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1051 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 
1054 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 
1017 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.14 
 
 
1011 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 
1073 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 
1018 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  33.69 
 
 
1045 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1025 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1057 aa  572  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 
1029 aa  569  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.87 
 
 
1046 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 
1089 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.25 
 
 
1028 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  32.91 
 
 
1015 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1029 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1028 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 
1047 aa  569  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  32.55 
 
 
1015 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  34.21 
 
 
1025 aa  569  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 
1049 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 
1021 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1048 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>