More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0663 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  73.99 
 
 		 1024 aa  1523    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  51.27 
 
 		 1025 aa  1031    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  48.37 
 
 		 1020 aa  986    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2084    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  52.45 
 
 		 1025 aa  1112    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.53 
 
 		 1014 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  50.74 
 
 		 1016 aa  1009    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1014 aa  804    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  53.54 
 
 		 1036 aa  1119    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  48.43 
 
 		 1041 aa  972    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  50.34 
 
 		 1028 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  99.81 
 
 		 1029 aa  2081    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.34 
 
 		 1028 aa  969    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.35 
 
 		 1027 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  41.37 
 
 		 1040 aa  849    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  45.08 
 
 		 1009 aa  882    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  75.44 
 
 		 1025 aa  1560    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  74.66 
 
 		 1028 aa  1560    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.69 
 
 		 1010 aa  963    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  92.39 
 
 		 1027 aa  1868    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1019 aa  865    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.25 
 
 		 1028 aa  965    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1017 aa  813    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  99.71 
 
 		 1029 aa  2076    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  52.59 
 
 		 1019 aa  1093    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  37.32 
 
 		 1020 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  75.44 
 
 		 1028 aa  1598    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  42.86 
 
 		 1013 aa  811    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  52.21 
 
 		 1023 aa  1076    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42 
 
 		 1013 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.58 
 
 		 1028 aa  1099    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1016 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.27 
 
 		 1017 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  52.88 
 
 		 1024 aa  1078    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  54.8 
 
 		 1021 aa  1130    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.17 
 
 		 1016 aa  849    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.29 
 
 		 1032 aa  1102    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1864    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  92.13 
 
 		 1029 aa  1866    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  40.96 
 
 		 1013 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  86.57 
 
 		 1021 aa  1774    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  92.9 
 
 		 1027 aa  1876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1029 aa  1050    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  52.84 
 
 		 1015 aa  1071    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  44.15 
 
 		 1043 aa  829    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  53.14 
 
 		 1036 aa  1107    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  98.74 
 
 		 1029 aa  2063    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  53.52 
 
 		 1019 aa  1101    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1056 aa  904    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  39.71 
 
 		 1012 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1035 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1035 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 		 1035 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1019 aa  588  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1051 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.36 
 
 		 1019 aa  565  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1054 aa  562  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.23 
 
 		 1039 aa  562  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1053 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1036 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.1 
 
 		 1027 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1039 aa  559  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  32.82 
 
 		 1025 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 		 1067 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1071 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1048 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.89 
 
 		 1041 aa  555  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1018 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1039 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1049 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1022 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1049 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1047 aa  552  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1048 aa  552  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.38 
 
 		 1045 aa  552  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1042 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1047 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 		 1060 aa  548  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1019 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1089 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1018 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1023 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1050 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1047 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1050 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1016 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1071 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1023 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1021 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1014 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.5 
 
 		 1022 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 1024 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.99 
 
 		 1057 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1046 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.92 
 
 		 1056 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1048 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.92 
 
 		 1056 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1049 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>