More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003809 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  54.55 
 
 		 1024 aa  1130    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  53.79 
 
 		 1028 aa  1113    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  93.82 
 
 		 1036 aa  1965    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  43.18 
 
 		 1014 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1041 aa  1062    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  100 
 
 		 1036 aa  2100    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  37.41 
 
 		 1020 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  46.21 
 
 		 1040 aa  937    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  53.68 
 
 		 1029 aa  1088    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  49.31 
 
 		 1015 aa  1026    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  53.48 
 
 		 1029 aa  1092    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  56.96 
 
 		 1019 aa  1203    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  53.48 
 
 		 1029 aa  1092    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  53.98 
 
 		 1025 aa  1118    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  81.91 
 
 		 1025 aa  1724    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  57.2 
 
 		 1019 aa  1211    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  53.39 
 
 		 1029 aa  1091    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  59.33 
 
 		 1028 aa  1266    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.71 
 
 		 1010 aa  1073    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  46.53 
 
 		 1019 aa  928    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 		 1020 aa  1013    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.45 
 
 		 1028 aa  962    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.71 
 
 		 1027 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  42.39 
 
 		 1013 aa  803    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  45.87 
 
 		 1056 aa  907    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  57.52 
 
 		 1023 aa  1207    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  52.12 
 
 		 1025 aa  1070    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  45.22 
 
 		 1017 aa  825    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  73.94 
 
 		 1021 aa  1581    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1016 aa  816    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  57.33 
 
 		 1024 aa  1219    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  39.19 
 
 		 1012 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  54.58 
 
 		 1027 aa  1088    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1035 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  54.48 
 
 		 1029 aa  1093    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  54.48 
 
 		 1029 aa  1094    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  85.34 
 
 		 1032 aa  1789    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1035 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.18 
 
 		 1013 aa  785    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  50.45 
 
 		 1028 aa  962    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  53.57 
 
 		 1021 aa  1095    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42 
 
 		 1013 aa  792    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  56.33 
 
 		 1029 aa  1154    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  43.71 
 
 		 1043 aa  848    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  42.28 
 
 		 1017 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  54.11 
 
 		 1028 aa  1136    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.35 
 
 		 1028 aa  959    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  48.49 
 
 		 1016 aa  980    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.54 
 
 		 1014 aa  809    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.39 
 
 		 1016 aa  850    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1035 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  54.58 
 
 		 1027 aa  1098    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  46.95 
 
 		 1009 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.97 
 
 		 1019 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 		 1036 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  33.77 
 
 		 1046 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  34.14 
 
 		 1071 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1039 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1039 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1053 aa  602  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1049 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  34.67 
 
 		 1025 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1019 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1044 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 		 1041 aa  602  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.65 
 
 		 1039 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1067 aa  598  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1089 aa  598  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1049 aa  598  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1041 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 		 1046 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33 
 
 		 1036 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  33.87 
 
 		 1046 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1051 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1024 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1047 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1054 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1047 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1019 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1045 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1060 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1016 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1048 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.76 
 
 		 1041 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 		 1046 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1021 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1021 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1021 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.94 
 
 		 1025 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1048 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  32.88 
 
 		 1015 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1018 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1049 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1031 aa  579  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  32.78 
 
 		 1015 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1049 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1057 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1021 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1047 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>