More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1729 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.94 
 
 		 1016 aa  791    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  51.33 
 
 		 1025 aa  1068    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  40.79 
 
 		 1013 aa  744    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  48.97 
 
 		 1027 aa  947    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  48.38 
 
 		 1029 aa  952    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1017 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  45.8 
 
 		 1028 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 		 1028 aa  1005    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  52.08 
 
 		 1021 aa  1058    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 		 1024 aa  966    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  45.9 
 
 		 1015 aa  914    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  36.98 
 
 		 1012 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  47.74 
 
 		 1029 aa  927    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  40.57 
 
 		 1056 aa  775    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  51.98 
 
 		 1036 aa  1063    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.43 
 
 		 1010 aa  941    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  48.48 
 
 		 1029 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  42.34 
 
 		 1019 aa  820    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  48.38 
 
 		 1029 aa  954    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  47.16 
 
 		 1020 aa  923    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.2 
 
 		 1014 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  75.17 
 
 		 1025 aa  1593    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.7 
 
 		 1028 aa  833    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  49.7 
 
 		 1023 aa  1028    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.9 
 
 		 1013 aa  752    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  48.38 
 
 		 1029 aa  952    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  45.54 
 
 		 1016 aa  868    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  48.48 
 
 		 1025 aa  957    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  39.69 
 
 		 1016 aa  716    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  43.49 
 
 		 1017 aa  764    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1024 aa  964    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2117    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  51.97 
 
 		 1032 aa  1055    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1029 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1029 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  38.5 
 
 		 1013 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  48.05 
 
 		 1028 aa  967    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  48.53 
 
 		 1021 aa  957    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1014 aa  765    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  41.39 
 
 		 1043 aa  788    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.3 
 
 		 1028 aa  1020    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  48.91 
 
 		 1019 aa  1000    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.8 
 
 		 1028 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  48.81 
 
 		 1019 aa  1003    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  51.9 
 
 		 1036 aa  1056    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  48.62 
 
 		 1027 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1009 aa  799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  42.55 
 
 		 1040 aa  843    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  35.17 
 
 		 1027 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  34.98 
 
 		 1020 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1035 aa  612  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1035 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1035 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1039 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1039 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.38 
 
 		 1039 aa  562  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.82 
 
 		 1025 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  32.06 
 
 		 1022 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.14 
 
 		 1019 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1041 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.14 
 
 		 1025 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1049 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1023 aa  539  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1051 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1071 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1024 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1060 aa  536  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1089 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1036 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1049 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.87 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1067 aa  532  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.87 
 
 		 1024 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1073 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1021 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1046 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1044 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1057 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.52 
 
 		 1027 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1021 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1021 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1022 aa  526  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1040 aa  526  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.4 
 
 		 1036 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.91 
 
 		 1041 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.82 
 
 		 1046 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1041 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1031 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1048 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1019 aa  521  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1023 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1049 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1047 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1049 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1021 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.64 
 
 		 1056 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>