More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4315 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  74.56 
 
 		 1029 aa  1541    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  74.66 
 
 		 1029 aa  1541    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  73.67 
 
 		 1027 aa  1498    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  53.69 
 
 		 1036 aa  1125    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.15 
 
 		 1028 aa  952    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.15 
 
 		 1032 aa  1113    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  74.56 
 
 		 1029 aa  1538    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  48.05 
 
 		 1041 aa  982    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  42.35 
 
 		 1013 aa  810    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  52.32 
 
 		 1015 aa  1063    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.53 
 
 		 1013 aa  789    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  85.45 
 
 		 1025 aa  1758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  50.59 
 
 		 1016 aa  1024    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 		 1014 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  74.36 
 
 		 1029 aa  1531    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  42.25 
 
 		 1017 aa  781    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  53.48 
 
 		 1019 aa  1102    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1028 aa  2076    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1056 aa  848    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1012 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.33 
 
 		 1010 aa  974    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.64 
 
 		 1014 aa  747    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  43.01 
 
 		 1019 aa  843    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  47.4 
 
 		 1020 aa  964    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  52.65 
 
 		 1025 aa  1129    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.29 
 
 		 1017 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.25 
 
 		 1028 aa  955    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  85.21 
 
 		 1028 aa  1804    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  52.17 
 
 		 1023 aa  1085    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  54.52 
 
 		 1021 aa  1134    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1016 aa  773    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  49.95 
 
 		 1025 aa  1006    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  52.15 
 
 		 1024 aa  1063    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  80.35 
 
 		 1024 aa  1647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.54 
 
 		 1028 aa  1092    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  74.36 
 
 		 1029 aa  1521    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  74.56 
 
 		 1029 aa  1525    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.98 
 
 		 1016 aa  827    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.75 
 
 		 1013 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  73.67 
 
 		 1021 aa  1526    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  52.68 
 
 		 1029 aa  1044    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  44.76 
 
 		 1043 aa  833    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 		 1040 aa  840    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  53.59 
 
 		 1036 aa  1119    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  53.19 
 
 		 1019 aa  1101    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1028 aa  955    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  74.66 
 
 		 1027 aa  1523    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  44.15 
 
 		 1009 aa  852    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1035 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1035 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  35.68 
 
 		 1027 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.27 
 
 		 1035 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  36.38 
 
 		 1020 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1051 aa  559  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.17 
 
 		 1039 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1019 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1046 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1053 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1039 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1041 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1036 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1039 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.94 
 
 		 1019 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1071 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1031 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.91 
 
 		 1024 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1023 aa  539  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1016 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1018 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1036 aa  539  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.93 
 
 		 1046 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1067 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.81 
 
 		 1024 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1019 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1023 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1046 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1046 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.19 
 
 		 1027 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1022 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1021 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1047 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1045 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.01 
 
 		 1022 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  32.85 
 
 		 1025 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1018 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.23 
 
 		 1036 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1049 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1050 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1060 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  30.58 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1048 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1048 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1054 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1089 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  29.34 
 
 		 1025 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1049 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1047 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1041 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>