More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02530 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  53.14 
 
 		 1029 aa  1021    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  47.68 
 
 		 1019 aa  956    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  49.11 
 
 		 1036 aa  992    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  44.49 
 
 		 1020 aa  875    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  45.9 
 
 		 1041 aa  891    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  65.51 
 
 		 1016 aa  1355    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  100 
 
 		 1015 aa  2041    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  42.74 
 
 		 1028 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  52.52 
 
 		 1028 aa  1047    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  48.22 
 
 		 1025 aa  993    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  52.84 
 
 		 1029 aa  1021    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  38.8 
 
 		 1013 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  38.33 
 
 		 1040 aa  739    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  52.03 
 
 		 1025 aa  1026    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.74 
 
 		 1028 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.37 
 
 		 1014 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.14 
 
 		 1010 aa  865    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  53.44 
 
 		 1024 aa  1043    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  41.22 
 
 		 1019 aa  789    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  47.98 
 
 		 1019 aa  964    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  52.84 
 
 		 1029 aa  1020    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 1014 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.65 
 
 		 1028 aa  792    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  49.31 
 
 		 1036 aa  998    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  48.57 
 
 		 1023 aa  996    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.74 
 
 		 1016 aa  754    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.54 
 
 		 1013 aa  723    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.2 
 
 		 1028 aa  998    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1016 aa  717    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  45.58 
 
 		 1024 aa  922    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.66 
 
 		 1032 aa  974    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  53.53 
 
 		 1029 aa  1013    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  53.48 
 
 		 1029 aa  1015    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  52.79 
 
 		 1029 aa  1016    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1013 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  53.14 
 
 		 1021 aa  1021    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  47.3 
 
 		 1029 aa  931    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  52.89 
 
 		 1027 aa  1011    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  41.32 
 
 		 1043 aa  770    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  37.89 
 
 		 1017 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  39.49 
 
 		 1056 aa  749    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  49.3 
 
 		 1021 aa  992    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  40.28 
 
 		 1017 aa  700    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  52.32 
 
 		 1028 aa  1021    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  40.89 
 
 		 1009 aa  762    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  46.1 
 
 		 1025 aa  928    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  53.09 
 
 		 1027 aa  1014    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  33.93 
 
 		 1027 aa  621  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  36.21 
 
 		 1012 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 		 1035 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1035 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  34.32 
 
 		 1020 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 		 1035 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1036 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1053 aa  532  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.29 
 
 		 1039 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1039 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.93 
 
 		 1027 aa  522  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.12 
 
 		 1022 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1060 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1044 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1067 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1049 aa  515  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1049 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1029 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1019 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1071 aa  512  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1051 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1046 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1036 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  29.75 
 
 		 1046 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1023 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1048 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1023 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1089 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1022 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1041 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1021 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  29.46 
 
 		 1040 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1047 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1018 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1029 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1021 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1046 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.4 
 
 		 1041 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1046 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1024 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1041 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1046 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.59 
 
 		 1025 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1021 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1560  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1026 aa  495  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.701497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.28 
 
 		 1019 aa  492  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1021 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1059 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1040 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1018 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.49 
 
 		 1025 aa  493  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>