More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1915 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1036 aa  919    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  39.49 
 
 		 1015 aa  783    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 		 1020 aa  798    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1028 aa  848    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  43.84 
 
 		 1025 aa  870    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  43.1 
 
 		 1024 aa  852    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.79 
 
 		 1020 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  46.26 
 
 		 1032 aa  935    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1056 aa  2140    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  45.65 
 
 		 1025 aa  941    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.72 
 
 		 1028 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  40.72 
 
 		 1028 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1029 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1029 aa  888    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  46.77 
 
 		 1010 aa  966    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  46.32 
 
 		 1019 aa  919    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.63 
 
 		 1028 aa  757    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  44.84 
 
 		 1029 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  45.21 
 
 		 1027 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  40.32 
 
 		 1017 aa  768    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1021 aa  932    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1016 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  43.03 
 
 		 1013 aa  833    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.09 
 
 		 1027 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1023 aa  867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  45.01 
 
 		 1029 aa  887    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  48.09 
 
 		 1040 aa  989    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  40.42 
 
 		 1016 aa  726    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  41.12 
 
 		 1025 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  41.55 
 
 		 1024 aa  845    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1012 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1014 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  45.14 
 
 		 1017 aa  835    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  44.74 
 
 		 1029 aa  883    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1029 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  39.02 
 
 		 1013 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.16 
 
 		 1014 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  42.8 
 
 		 1019 aa  868    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  43.88 
 
 		 1021 aa  868    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.22 
 
 		 1016 aa  851    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1029 aa  805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  42.61 
 
 		 1019 aa  864    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 		 1043 aa  765    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.9 
 
 		 1013 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  44.59 
 
 		 1028 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  40.57 
 
 		 1041 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  45.87 
 
 		 1036 aa  918    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 		 1027 aa  880    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  49.38 
 
 		 1009 aa  1008    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.99 
 
 		 1028 aa  886    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1035 aa  619  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1035 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1035 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.55 
 
 		 1027 aa  592  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.02 
 
 		 1025 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1089 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1051 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1071 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.11 
 
 		 1019 aa  572  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1018 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.2 
 
 		 1025 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1067 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1053 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1016 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1022 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1047 aa  565  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1024 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.92 
 
 		 1025 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1019 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1036 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 		 1019 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1022 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1023 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  30.87 
 
 		 1041 aa  559  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1031 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1018 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1049 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1021 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1021 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1049 aa  552  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1036 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1021 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1023 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1060 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1067 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1073 aa  552  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  31.6 
 
 		 1025 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1021 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  30.77 
 
 		 1015 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  29.85 
 
 		 1039 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1071 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  30.67 
 
 		 1015 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1050 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.1 
 
 		 1056 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1021 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.1 
 
 		 1056 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1039 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.1 
 
 		 1056 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>