More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0670 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  44.41 
 
 		 1014 aa  821    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  47.39 
 
 		 1019 aa  971    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  40.39 
 
 		 1012 aa  701    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.73 
 
 		 1019 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  44.79 
 
 		 1020 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  47.79 
 
 		 1029 aa  924    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.47 
 
 		 1032 aa  1050    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  45.5 
 
 		 1017 aa  858    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  52.71 
 
 		 1036 aa  1053    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  46.8 
 
 		 1019 aa  957    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  42.84 
 
 		 1016 aa  813    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  52.02 
 
 		 1025 aa  1056    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  48.33 
 
 		 1028 aa  947    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  44.14 
 
 		 1015 aa  875    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  38.55 
 
 		 1027 aa  733    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  48.59 
 
 		 1040 aa  985    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  100 
 
 		 1010 aa  2046    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1019 aa  988    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  47.69 
 
 		 1029 aa  922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  48.29 
 
 		 1027 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  52.62 
 
 		 1036 aa  1051    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  46.77 
 
 		 1056 aa  944    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  48.33 
 
 		 1028 aa  964    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  45.66 
 
 		 1023 aa  917    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  45.64 
 
 		 1016 aa  825    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  47.61 
 
 		 1028 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  46.96 
 
 		 1024 aa  940    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  47.6 
 
 		 1029 aa  917    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.42 
 
 		 1016 aa  888    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  38.05 
 
 		 1035 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  47.99 
 
 		 1029 aa  916    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  48.09 
 
 		 1029 aa  918    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  38.05 
 
 		 1035 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  48.58 
 
 		 1024 aa  955    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  44.25 
 
 		 1013 aa  824    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.61 
 
 		 1028 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  47.64 
 
 		 1021 aa  930    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.09 
 
 		 1013 aa  774    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  47.7 
 
 		 1029 aa  927    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  47.43 
 
 		 1041 aa  925    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  45.82 
 
 		 1043 aa  837    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  49.6 
 
 		 1017 aa  905    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  47.5 
 
 		 1029 aa  913    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  45.81 
 
 		 1025 aa  922    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 		 1021 aa  1010    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.51 
 
 		 1028 aa  855    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  37.6 
 
 		 1020 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  47.77 
 
 		 1013 aa  916    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 		 1035 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  47.64 
 
 		 1027 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  48.06 
 
 		 1009 aa  959    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  48.82 
 
 		 1025 aa  966    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  49.95 
 
 		 1028 aa  1022    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.16 
 
 		 1014 aa  821    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 		 1019 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  36.04 
 
 		 1025 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1036 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1089 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1071 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.33 
 
 		 1027 aa  605  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1067 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1051 aa  602  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1047 aa  602  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.75 
 
 		 1039 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1039 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  34.6 
 
 		 1041 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1039 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1060 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1036 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.84 
 
 		 1024 aa  588  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.97 
 
 		 1053 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.74 
 
 		 1024 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1046 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1049 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1031 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1019 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1044 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1049 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1022 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1041 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.71 
 
 		 1036 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  32.25 
 
 		 1025 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1042 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1067 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1024 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1029 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  33.07 
 
 		 1025 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1018 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1031 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1046 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1041 aa  568  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 		 1050 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1051 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1054 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  32.68 
 
 		 1045 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1045 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.68 
 
 		 1025 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.71 
 
 		 1017 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1056 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1046 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>