More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2039 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  44.37 
 
 		 1071 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  43.47 
 
 		 1046 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  46.37 
 
 		 1021 aa  892    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  40.37 
 
 		 1030 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  63.94 
 
 		 1017 aa  1334    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  63.41 
 
 		 1021 aa  1326    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.32 
 
 		 1017 aa  803    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  45.97 
 
 		 1039 aa  902    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  40.84 
 
 		 1040 aa  762    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  67.48 
 
 		 1031 aa  1421    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  40.31 
 
 		 1020 aa  745    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  46.43 
 
 		 1041 aa  882    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1067 aa  833    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  68.16 
 
 		 1024 aa  1430    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  63.63 
 
 		 1021 aa  1301    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.57 
 
 		 1036 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.74 
 
 		 1011 aa  1215    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  62.28 
 
 		 1033 aa  1308    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.08 
 
 		 1056 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  62.32 
 
 		 1033 aa  1307    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  39.2 
 
 		 1039 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  59.55 
 
 		 1012 aa  1219    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  44.67 
 
 		 1047 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  48.16 
 
 		 1017 aa  930    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  46.27 
 
 		 1036 aa  905    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5639  acriflavin resistance protein  40.51 
 
 		 1047 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  46.15 
 
 		 1022 aa  882    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1030 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.18 
 
 		 1056 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  62.52 
 
 		 1017 aa  1295    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  46.07 
 
 		 1022 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1029 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  45.02 
 
 		 1048 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  42.17 
 
 		 1037 aa  773    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  44.73 
 
 		 1048 aa  838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  100 
 
 		 1025 aa  2064    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  63.74 
 
 		 1017 aa  1333    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  45.97 
 
 		 1040 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  64.45 
 
 		 1044 aa  1335    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1703  acriflavin resistance protein  39.73 
 
 		 1021 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.27 
 
 		 1056 aa  823    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.61 
 
 		 1057 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  45.18 
 
 		 1049 aa  844    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  80.75 
 
 		 1018 aa  1676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1046 aa  842    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  68.07 
 
 		 1024 aa  1427    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  63.01 
 
 		 1015 aa  1311    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  43.64 
 
 		 1060 aa  839    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  43.84 
 
 		 1046 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1059 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  45.82 
 
 		 1067 aa  878    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  45.81 
 
 		 1025 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1089 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3446  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 		 1024 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  45.05 
 
 		 1045 aa  841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  77.25 
 
 		 1110 aa  1577    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  44.99 
 
 		 1047 aa  870    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  43.2 
 
 		 1056 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  81.83 
 
 		 1018 aa  1696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  43.08 
 
 		 1046 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  43.29 
 
 		 1044 aa  841    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  45.77 
 
 		 1036 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  40.25 
 
 		 1045 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1046 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  44.87 
 
 		 1049 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  52.89 
 
 		 1031 aa  1052    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  63.31 
 
 		 1020 aa  1327    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 		 1029 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  38.18 
 
 		 1011 aa  683    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  43.94 
 
 		 1050 aa  825    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.18 
 
 		 1056 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  47.05 
 
 		 1053 aa  899    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  64.34 
 
 		 1020 aa  1326    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 		 1029 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  81.65 
 
 		 1019 aa  1712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  46.77 
 
 		 1024 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  43.26 
 
 		 1071 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  43.55 
 
 		 1041 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  46.27 
 
 		 1021 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  46.07 
 
 		 1021 aa  878    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5653  acriflavin resistance protein  39.16 
 
 		 1022 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235963  hitchhiker  0.00278387 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  39.78 
 
 		 1049 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0808  RND family mulitdrug efflux protein  51.32 
 
 		 1037 aa  969    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485603  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  53.4 
 
 		 1014 aa  1061    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  45.1 
 
 		 1047 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  40.16 
 
 		 1045 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  63.3 
 
 		 1015 aa  1319    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  45.71 
 
 		 1025 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.26 
 
 		 1029 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  44.87 
 
 		 1049 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1046 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  38.38 
 
 		 1012 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  46.07 
 
 		 1021 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1047 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1046 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  41.73 
 
 		 1035 aa  782    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2561  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1038 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.224795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  57.5 
 
 		 1031 aa  1138    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1054 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  45.29 
 
 		 1050 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>