More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3993 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  49.26 
 
 		 1019 aa  1018    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  41.12 
 
 		 1056 aa  792    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  51.03 
 
 		 1029 aa  988    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.54 
 
 		 1014 aa  720    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  75.17 
 
 		 1041 aa  1572    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 		 1028 aa  977    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  51.62 
 
 		 1036 aa  1046    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  51.13 
 
 		 1029 aa  993    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.71 
 
 		 1012 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.22 
 
 		 1016 aa  783    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  46.94 
 
 		 1016 aa  899    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  48.97 
 
 		 1029 aa  946    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  45.81 
 
 		 1010 aa  920    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  50.1 
 
 		 1025 aa  977    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  42.1 
 
 		 1019 aa  818    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.5 
 
 		 1032 aa  1056    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1021 aa  1044    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  51.52 
 
 		 1025 aa  1061    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.47 
 
 		 1013 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  51.22 
 
 		 1029 aa  994    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  41.87 
 
 		 1017 aa  733    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1023 aa  1038    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  49.16 
 
 		 1028 aa  1005    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1027 aa  974    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1016 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  50.98 
 
 		 1028 aa  1012    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  47.18 
 
 		 1028 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  48.62 
 
 		 1024 aa  983    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.08 
 
 		 1028 aa  869    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  51.96 
 
 		 1029 aa  991    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1017 aa  727    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  51.96 
 
 		 1029 aa  991    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  49.41 
 
 		 1019 aa  1022    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  100 
 
 		 1025 aa  2068    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1013 aa  693    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  39.98 
 
 		 1013 aa  735    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  50.49 
 
 		 1021 aa  983    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  46.15 
 
 		 1020 aa  914    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1014 aa  754    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  40.39 
 
 		 1043 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  51.22 
 
 		 1029 aa  994    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.18 
 
 		 1028 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  52.12 
 
 		 1036 aa  1053    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  46.1 
 
 		 1015 aa  930    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  50.84 
 
 		 1024 aa  986    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  41.36 
 
 		 1040 aa  829    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  51.57 
 
 		 1027 aa  986    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  42.63 
 
 		 1009 aa  799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.36 
 
 		 1020 aa  622  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  34.9 
 
 		 1027 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 		 1035 aa  602  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 		 1035 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1035 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1044 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.78 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1046 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.5 
 
 		 1019 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1046 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1036 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.94 
 
 		 1022 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1060 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.1 
 
 		 1046 aa  532  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1051 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1049 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1045 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1041 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1036 aa  526  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1071 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1056 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1067 aa  522  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1041 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.36 
 
 		 1025 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1023 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1059 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1046 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 		 1021 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1089 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.76 
 
 		 1025 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.97 
 
 		 1027 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1014 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1021 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1051 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1023 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1021 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1050 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.88 
 
 		 1036 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1021 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1019 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1029 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1031 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1031 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.5 
 
 		 1024 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5212  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.52 
 
 		 1034 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1016 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1022 aa  502  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>