More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2714 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.04 
 
 		 1028 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1013 aa  781    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  43.58 
 
 		 1024 aa  803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  60.75 
 
 		 1014 aa  1146    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  42.58 
 
 		 1014 aa  737    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  41.87 
 
 		 1025 aa  773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1029 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1012 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  41 
 
 		 1019 aa  767    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1017 aa  1987    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  40.88 
 
 		 1015 aa  754    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  44.54 
 
 		 1025 aa  865    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.26 
 
 		 1028 aa  842    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1029 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  43.79 
 
 		 1029 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.05 
 
 		 1010 aa  946    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  43.94 
 
 		 1028 aa  755    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  44.83 
 
 		 1019 aa  867    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  46.06 
 
 		 1032 aa  865    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  44.04 
 
 		 1028 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  42.94 
 
 		 1025 aa  801    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  45.52 
 
 		 1036 aa  860    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  45.14 
 
 		 1056 aa  861    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1017 aa  966    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  41.55 
 
 		 1023 aa  770    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  41.02 
 
 		 1019 aa  770    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  43.82 
 
 		 1016 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  43.68 
 
 		 1028 aa  828    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  42.35 
 
 		 1028 aa  799    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  41.59 
 
 		 1024 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  44.22 
 
 		 1027 aa  824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 		 1016 aa  738    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1029 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  44.36 
 
 		 1027 aa  815    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1029 aa  822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1029 aa  821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  61.86 
 
 		 1016 aa  1260    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1013 aa  716    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  45.22 
 
 		 1036 aa  856    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1021 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  41.83 
 
 		 1029 aa  810    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  40.25 
 
 		 1020 aa  754    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  42.76 
 
 		 1043 aa  745    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  43.8 
 
 		 1021 aa  831    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  43.49 
 
 		 1041 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  37.33 
 
 		 1027 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.06 
 
 		 1013 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  44.36 
 
 		 1040 aa  853    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  44.36 
 
 		 1009 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  36.22 
 
 		 1020 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1035 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 		 1035 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.98 
 
 		 1027 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 		 1035 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1022 aa  572  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1036 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  35.35 
 
 		 1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1039 aa  552  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1019 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  33.85 
 
 		 1039 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  34.15 
 
 		 1025 aa  549  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1036 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1018 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1047 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.59 
 
 		 1019 aa  535  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1033 aa  536  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1016 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1019 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1023 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.77 
 
 		 1033 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1020 aa  532  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1020 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.75 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1023 aa  529  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1018 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  33.21 
 
 		 1041 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  32.75 
 
 		 1024 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1031 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1021 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4856  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287166  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1067 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1054 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1020 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1031 aa  519  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1041 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1021 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1049 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1017 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.43 
 
 		 1017 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1012 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1017 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1041 aa  515  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1049 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1021 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1046 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1060 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1044 aa  512  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  31.62 
 
 		 1015 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>