More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1419 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  50.59 
 
 
1028 aa  1018    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  48.96 
 
 
1036 aa  998    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 
1027 aa  973    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.13 
 
 
1028 aa  972    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  45.54 
 
 
1041 aa  880    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  46.94 
 
 
1025 aa  926    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  41.67 
 
 
1017 aa  718    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  40.75 
 
 
1014 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  48.77 
 
 
1032 aa  966    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  65.45 
 
 
1015 aa  1393    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 
1056 aa  739    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 
1017 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  48.47 
 
 
1036 aa  989    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  51.47 
 
 
1028 aa  1049    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  48.47 
 
 
1019 aa  979    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  39.39 
 
 
1013 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.91 
 
 
1014 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.84 
 
 
1010 aa  842    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.28 
 
 
1028 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  39.94 
 
 
1019 aa  775    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1016 aa  2045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 
1040 aa  746    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  50.54 
 
 
1029 aa  991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  50.64 
 
 
1029 aa  991    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  44.28 
 
 
1028 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  47.2 
 
 
1023 aa  979    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.43 
 
 
1013 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  44.18 
 
 
1028 aa  810    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  41.47 
 
 
1016 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 
1029 aa  989    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  48.32 
 
 
1019 aa  977    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  47.25 
 
 
1024 aa  953    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  45.93 
 
 
1020 aa  899    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  50.74 
 
 
1029 aa  995    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  50.88 
 
 
1029 aa  984    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  50.88 
 
 
1029 aa  983    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  39.07 
 
 
1016 aa  749    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  48.86 
 
 
1021 aa  981    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  51.37 
 
 
1021 aa  998    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  47.41 
 
 
1029 aa  944    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 
1043 aa  765    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  51.23 
 
 
1025 aa  1025    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  48.02 
 
 
1025 aa  984    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 
1024 aa  1019    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 
1027 aa  992    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 
1009 aa  795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  37.66 
 
 
1013 aa  635  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 
1012 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  34.87 
 
 
1027 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 
1035 aa  569  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 
1035 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  33.04 
 
 
1020 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 
1035 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 
1036 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.88 
 
 
1039 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 
1053 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  33.17 
 
 
1022 aa  539  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 
1023 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.75 
 
 
1025 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
1019 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 
1051 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1067 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.52 
 
 
1025 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1029 aa  529  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 
1039 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 
1023 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 
1039 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 
1089 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 
1024 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 
1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 
1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 
1045 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 
1046 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 
1046 aa  516  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 
1019 aa  512  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 
1016 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 
1046 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 
1049 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.06 
 
 
1027 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1047 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 
1049 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1050 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 
1044 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 
1054 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 
1021 aa  506  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 
1021 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 
1021 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 
1056 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.94 
 
 
1041 aa  505  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 
1056 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 
1018 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 
1044 aa  506  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 
1071 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 
1021 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 
1056 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.13 
 
 
1046 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1053 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 
1020 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 
1056 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 
1020 aa  502  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.556784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>