More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2558 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1035 aa  2099    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1020 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1012 aa  512  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.79 
 
 		 1039 aa  502  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1039 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1039 aa  502  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.63 
 
 		 1027 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1036 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1047 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1036 aa  486  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1019 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.01 
 
 		 1028 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.38 
 
 		 1019 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  29.61 
 
 		 1022 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1067 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1021 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1021 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1021 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1023 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1051 aa  472  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  30.87 
 
 		 1025 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1036 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1056 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.67 
 
 		 1019 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1051 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1021 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.09 
 
 		 1025 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1021 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1048 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  28.92 
 
 		 1025 aa  465  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.09 
 
 		 1025 aa  466  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1047 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1019 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  29.96 
 
 		 1036 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1049 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1029 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1019 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1049 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.79 
 
 		 1032 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1059 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  28.7 
 
 		 1046 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1024 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1013 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1024 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  28.59 
 
 		 1041 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.81 
 
 		 1010 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1089 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1022 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  30.04 
 
 		 1025 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1009 aa  452  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1045 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1016 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1022 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1023 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 1017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1073 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  28.75 
 
 		 1027 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1021 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1023 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1044 aa  445  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1035 aa  446  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1035 aa  446  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1013 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1040 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1041 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1019 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1021 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1014 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1047 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  30.11 
 
 		 1110 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1018 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1046 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1046 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1017 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1053 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1029 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1017 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1053 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  28.68 
 
 		 1020 aa  436  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.12 
 
 		 1024 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1020 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  27.51 
 
 		 1015 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1014 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  28.98 
 
 		 1045 aa  436  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1018 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1047 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  27.42 
 
 		 1015 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1071 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2902  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1236 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1033 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1060 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1047 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1049 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1035 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5212  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.65 
 
 		 1034 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1031 aa  432  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>