More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3981 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  42.57 
 
 		 1020 aa  822    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  56.72 
 
 		 1026 aa  1076    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  53.09 
 
 		 1028 aa  1058    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1014 aa  2046    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1030 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1026 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.53 
 
 		 1024 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1020 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1043 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1011 aa  426  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1029 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1035 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1038 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1009 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1038 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1092 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1043 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1034 aa  392  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1048 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1059 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1044 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1053 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1050 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1055 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1047 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1058 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1008 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1021 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1041 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1023 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1023 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1063 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1036 aa  364  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1143 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1070 aa  362  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1191 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1023 aa  360  8e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1028 aa  360  9e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1054 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1039 aa  360  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1054 aa  359  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1057 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1034 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1047 aa  358  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1028 aa  357  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1042 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1054 aa  357  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.98 
 
 		 1024 aa  357  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1046 aa  357  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.35 
 
 		 1019 aa  357  8.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.11 
 
 		 1036 aa  355  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 1134 aa  354  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1038 aa  353  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1051 aa  353  7e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.54 
 
 		 1033 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1067 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1045 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1033 aa  351  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1071 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1046 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1051 aa  350  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1050 aa  350  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  26.8 
 
 		 1023 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4437  cation/multidrug efflux pump-like protein  64.93 
 
 		 299 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1015 aa  349  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  26.42 
 
 		 1015 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1019 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1105 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1036 aa  349  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1044 aa  349  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1048 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1019 aa  348  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.42 
 
 		 1024 aa  348  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1044 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1095 aa  347  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1039 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1040 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  24 
 
 		 1046 aa  347  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.69 
 
 		 1068 aa  347  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  26.23 
 
 		 1015 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.39 
 
 		 1040 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1041 aa  346  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1019 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1067 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  25.58 
 
 		 1039 aa  344  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1026 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.75 
 
 		 1026 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1016 aa  344  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1046 aa  344  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 1496 aa  343  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1041 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1059 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1039 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1042 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1046 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1026 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>