More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1147 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  77.96 
 
 		 1026 aa  1597    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  76.38 
 
 		 1038 aa  1521    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  78.73 
 
 		 1022 aa  1634    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 		 1029 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  74.41 
 
 		 1023 aa  1536    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  78.73 
 
 		 1022 aa  1630    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  78.43 
 
 		 1022 aa  1628    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  41.22 
 
 		 1039 aa  738    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  78.73 
 
 		 1022 aa  1632    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  77.12 
 
 		 1030 aa  1555    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  83.6 
 
 		 1023 aa  1725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  77.87 
 
 		 1025 aa  1596    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  37.63 
 
 		 1037 aa  686    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  78.95 
 
 		 1026 aa  1619    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  78.66 
 
 		 1026 aa  1613    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1021 aa  2049    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1049 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  77.02 
 
 		 1026 aa  1543    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.67 
 
 		 1048 aa  712    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  78.95 
 
 		 1026 aa  1618    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  72.77 
 
 		 1022 aa  1452    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.22 
 
 		 830 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1008 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1019 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1019 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  29.22 
 
 		 1019 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.9 
 
 		 1019 aa  393  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.07 
 
 		 1028 aa  380  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1020 aa  376  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1026 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1014 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1035 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1022 aa  362  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.31 
 
 		 1010 aa  358  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1021 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1021 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1021 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1046 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1012 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1046 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.52 
 
 		 1016 aa  353  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.42 
 
 		 1027 aa  353  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1023 aa  353  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1051 aa  353  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1009 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1020 aa  351  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.74 
 
 		 1025 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1044 aa  349  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1056 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1045 aa  348  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  26.27 
 
 		 1022 aa  347  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1021 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1046 aa  347  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.67 
 
 		 1025 aa  346  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  26.65 
 
 		 1025 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1009 aa  345  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1024 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1035 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1053 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1035 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1028 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1041 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  26.72 
 
 		 1020 aa  339  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  27.29 
 
 		 1015 aa  339  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1027 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.57 
 
 		 1046 aa  337  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1030 aa  337  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1020 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1029 aa  334  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1040 aa  333  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1019 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3321  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1021 aa  332  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1029 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1013 aa  330  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1027 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1036 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1029 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1029 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  26.87 
 
 		 1027 aa  327  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1059 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1073 aa  327  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1029 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1029 aa  327  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1026 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1029 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1029 aa  326  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1022 aa  325  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  26.19 
 
 		 1024 aa  324  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  26.19 
 
 		 1024 aa  324  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1047 aa  324  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1047 aa  324  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1018 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1048 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1041 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1054 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1012 aa  323  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  26.43 
 
 		 1025 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1014 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1027 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>