More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00488 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 		 1030 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.51 
 
 		 1026 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  39.94 
 
 		 1022 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  38.72 
 
 		 1023 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1022 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1048 aa  2115    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1029 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  37.66 
 
 		 1026 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  39.28 
 
 		 1025 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 		 1022 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1039 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1038 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  38.27 
 
 		 1023 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1026 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1026 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1022 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1021 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  39.75 
 
 		 1022 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.34 
 
 		 1049 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1026 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1037 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  39.26 
 
 		 830 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1020 aa  365  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1008 aa  356  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1035 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1012 aa  324  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1019 aa  323  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.38 
 
 		 1027 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.24 
 
 		 1019 aa  320  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1019 aa  317  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.01 
 
 		 1020 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1035 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1029 aa  311  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1037 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1029 aa  310  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1560  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1026 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.701497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1035 aa  308  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1026 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1014 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1046 aa  307  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1030 aa  307  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1029 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1046 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1046 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1020 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1022 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  26.4 
 
 		 1040 aa  305  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1035 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1703  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1021 aa  303  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1011 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1059 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1012 aa  300  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1045 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3321  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1021 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1015 aa  299  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1047 aa  299  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1025 aa  298  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0998  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1027 aa  297  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1039 aa  296  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  23.86 
 
 		 1039 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.2 
 
 		 1029 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1030 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1038 aa  294  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1036 aa  294  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1045 aa  294  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  25.22 
 
 		 1030 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1028 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2561  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1038 aa  293  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.224795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1053 aa  293  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  23.76 
 
 		 1039 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1046 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1017 aa  292  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0428  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1035 aa  292  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1050 aa  293  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.78 
 
 		 1036 aa  292  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  25.48 
 
 		 1045 aa  291  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1046 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1016 aa  289  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1013 aa  289  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1040 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1019 aa  288  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2677  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1029 aa  287  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.15 
 
 		 1014 aa  287  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  23.57 
 
 		 1039 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  25.29 
 
 		 1015 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1050 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1041 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  23.14 
 
 		 1044 aa  285  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  25.38 
 
 		 1019 aa  285  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5639  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1047 aa  285  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1056 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  24.34 
 
 		 1036 aa  282  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  23.69 
 
 		 1036 aa  283  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1048 aa  282  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1067 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1042 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1047 aa  281  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1051 aa  281  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1049 aa  281  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1049 aa  281  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>