More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3113 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1030 aa  2062    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  77.89 
 
 		 1022 aa  1587    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  75.72 
 
 		 1026 aa  1533    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  77.89 
 
 		 1022 aa  1585    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  80.75 
 
 		 1038 aa  1630    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  38.77 
 
 		 1029 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  77.89 
 
 		 1022 aa  1583    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  74.05 
 
 		 1022 aa  1481    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1039 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  76.98 
 
 		 1023 aa  1583    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.62 
 
 		 1048 aa  706    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  36.86 
 
 		 1037 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  76.57 
 
 		 1026 aa  1567    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  76.47 
 
 		 1026 aa  1566    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  77.49 
 
 		 1022 aa  1579    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  86.63 
 
 		 1026 aa  1721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  77.12 
 
 		 1021 aa  1608    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  80 
 
 		 1023 aa  1656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  39 
 
 		 1049 aa  710    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  76.73 
 
 		 1025 aa  1549    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  76.67 
 
 		 1026 aa  1568    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.82 
 
 		 830 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1008 aa  426  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1019 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1019 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.33 
 
 		 1019 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.24 
 
 		 1019 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1014 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1020 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1009 aa  354  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1035 aa  353  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.54 
 
 		 1028 aa  353  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1012 aa  352  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1021 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1021 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1021 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1022 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1051 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1020 aa  339  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1024 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1030 aa  336  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.41 
 
 		 1025 aa  335  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1048 aa  335  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1021 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.04 
 
 		 1025 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.6 
 
 		 1027 aa  333  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1049 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1049 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  25.95 
 
 		 1025 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1048 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1047 aa  330  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1050 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1047 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1029 aa  329  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1024 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  25.62 
 
 		 1040 aa  327  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1059 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1025 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1019 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1046 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1046 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1044 aa  325  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1046 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1046 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1017 aa  324  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1046 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  25.81 
 
 		 1022 aa  324  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1020 aa  324  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1053 aa  321  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1040 aa  320  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1046 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  26.41 
 
 		 1020 aa  320  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1045 aa  320  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1022 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1023 aa  319  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1057 aa  320  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.65 
 
 		 1046 aa  319  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1029 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1056 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1029 aa  318  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1041 aa  318  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.01 
 
 		 1056 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1014 aa  317  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1045 aa  317  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1029 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26 
 
 		 1056 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1029 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26 
 
 		 1056 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1036 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1027 aa  316  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.41 
 
 		 1027 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1029 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1029 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1045 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1029 aa  315  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26 
 
 		 1056 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1026 aa  314  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.35 
 
 		 1010 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>