More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0187 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.52 
 
 		 1027 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  71.11 
 
 		 1018 aa  1479    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1015 aa  798    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1022 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1027 aa  2059    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  35.79 
 
 		 1029 aa  599  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  34.27 
 
 		 1025 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0212  acriflavin resistance protein  96.96 
 
 		 296 aa  572  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.16 
 
 		 1019 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1019 aa  548  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1044 aa  538  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1046 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  31.84 
 
 		 1046 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1012 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.71 
 
 		 1010 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1041 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1046 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1046 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1051 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1045 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1013 aa  503  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1053 aa  499  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1009 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1041 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1056 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1048 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.05 
 
 		 1017 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1036 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1047 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1019 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1013 aa  486  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1036 aa  483  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.33 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1050 aa  483  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1024 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.96 
 
 		 1039 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  30.92 
 
 		 1022 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1059 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1023 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1040 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.14 
 
 		 1032 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1039 aa  476  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  29.97 
 
 		 1036 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1036 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1042 aa  476  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1039 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1047 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1023 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  30.32 
 
 		 1045 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  31.24 
 
 		 1017 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1037 aa  466  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  29.8 
 
 		 1040 aa  465  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1019 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0428  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1035 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.28 
 
 		 1025 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1029 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.75 
 
 		 1019 aa  465  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1021 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1051 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1019 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1035 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  29.99 
 
 		 1025 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1018 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1049 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1018 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1035 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  29.33 
 
 		 1020 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1021 aa  459  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1021 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1017 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1054 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.67 
 
 		 1028 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1021 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1017 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1048 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1048 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1053 aa  456  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1049 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1029 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1036 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1035 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1035 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1021 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1021 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1049 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.18 
 
 		 1033 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1033 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1047 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1067 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1049 aa  452  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1050 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1025 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1029 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1060 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1046 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1024 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1046 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1016 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1029 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.33 
 
 		 1057 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>