More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0212 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0212  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  96.96 
 
 		 1027 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  68.46 
 
 		 1018 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1022 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.9 
 
 		 1027 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1015 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1029 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 		 1019 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  31.19 
 
 		 1025 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.11 
 
 		 1041 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  29.97 
 
 		 1039 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1036 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1071 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1039 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1036 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1060 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1047 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1017 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1017 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1039 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.96 
 
 		 1033 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1033 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1049 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 1017 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1049 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1089 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1017 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1023 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1071 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1035 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2677  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1029 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  28.96 
 
 		 1015 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1022 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1023 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1044 aa  149  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  28.96 
 
 		 1015 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1037 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1021 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0808  RND family mulitdrug efflux protein  30.54 
 
 		 1037 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485603  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0428  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1035 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1046 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1036 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1024 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1051 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1035 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1020 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1035 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1703  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1021 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1011 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1019 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.27 
 
 		 1017 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  28.38 
 
 		 1030 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.27 
 
 		 1036 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1067 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1014 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1030 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1036 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  29.29 
 
 		 1046 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1021 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1029 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  27.27 
 
 		 1025 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1029 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  27.27 
 
 		 1110 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1021 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1053 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1035 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3321  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1021 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.2 
 
 		 1010 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1035 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.53 
 
 		 1019 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1049 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1013 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1019 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1020 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1021 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1016 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1031 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1035 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1021 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1039 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2689  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1026 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1018 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1018 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1029 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5212  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 		 1034 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.04 
 
 		 1028 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1012 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2561  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1038 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.224795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1012 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1047 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  28.82 
 
 		 1036 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.28 
 
 		 1011 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.52 
 
 		 1027 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1017 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1012 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1056 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1053 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1067 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.95 
 
 		 1025 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.69 
 
 		 1020 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>