More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0427 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 
1053 aa  876    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 
1017 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 
1021 aa  741    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  47.19 
 
 
1030 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 
1017 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.85 
 
 
1056 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  39.92 
 
 
1041 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  47.88 
 
 
1029 aa  958    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.94 
 
 
1017 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  39.59 
 
 
1039 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  48.86 
 
 
1040 aa  966    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 
1031 aa  710    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  48.51 
 
 
1046 aa  962    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  45.03 
 
 
1046 aa  901    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 
1047 aa  706    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.42 
 
 
1024 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5653  acriflavin resistance protein  48.27 
 
 
1022 aa  918    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235963  hitchhiker  0.00278387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.57 
 
 
1036 aa  955    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.74 
 
 
1011 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.5 
 
 
1033 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.75 
 
 
1056 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  37.86 
 
 
1033 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  48.03 
 
 
1039 aa  923    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 
1012 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  39 
 
 
1021 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 
1047 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  40.99 
 
 
1036 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5639  acriflavin resistance protein  49.95 
 
 
1047 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 
1044 aa  714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  39.8 
 
 
1022 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  37.62 
 
 
1021 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.85 
 
 
1056 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 
1017 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  40.47 
 
 
1022 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  48.02 
 
 
1029 aa  932    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 
1047 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  48.57 
 
 
1045 aa  955    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 
1048 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  37.54 
 
 
1071 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.42 
 
 
1024 aa  705    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 
1014 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2561  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 
1038 aa  960    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.224795  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 
1040 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0590  acriflavin resistance protein  93.87 
 
 
1011 aa  1863    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1703  acriflavin resistance protein  54.5 
 
 
1021 aa  1058    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  47.77 
 
 
1020 aa  957    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.85 
 
 
1056 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  38.85 
 
 
1020 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.1 
 
 
1057 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  38.67 
 
 
1031 aa  661    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 
1018 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  44.75 
 
 
1046 aa  890    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 
1024 aa  778    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  38.69 
 
 
1015 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  38.24 
 
 
1060 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 
1046 aa  893    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  40.49 
 
 
1059 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  40.13 
 
 
1067 aa  725    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  39.34 
 
 
1049 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  38.06 
 
 
1089 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1012 aa  2016    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3446  acriflavin resistance protein  48.81 
 
 
1024 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469211  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  38.65 
 
 
1045 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0808  RND family mulitdrug efflux protein  38.1 
 
 
1037 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485603  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  38.38 
 
 
1021 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  43.27 
 
 
1056 aa  836    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  36.82 
 
 
1018 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  43.94 
 
 
1046 aa  883    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  44.43 
 
 
1044 aa  885    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  40.47 
 
 
1036 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  38.08 
 
 
1019 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  48.51 
 
 
1046 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 
1049 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  39.86 
 
 
1025 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 
1048 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 
1067 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  47.29 
 
 
1030 aa  904    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  38.26 
 
 
1071 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  38 
 
 
1031 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  39.15 
 
 
1054 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  39.88 
 
 
1021 aa  736    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  51.28 
 
 
1037 aa  1012    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  48.37 
 
 
1029 aa  962    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  37.65 
 
 
1110 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  37.3 
 
 
1020 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  45.85 
 
 
1041 aa  861    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  39.78 
 
 
1021 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  39.22 
 
 
1050 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  50.15 
 
 
1035 aa  1013    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  39.32 
 
 
1050 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  38.38 
 
 
1025 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  47.19 
 
 
1049 aa  945    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 
1047 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  48.27 
 
 
1045 aa  952    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  38.79 
 
 
1015 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  39.67 
 
 
1025 aa  735    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.62 
 
 
1029 aa  938    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 
1049 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  48.51 
 
 
1046 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 
1029 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>