More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2023 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1027 aa  798    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1015 aa  2013    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1018 aa  780    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1022 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.97 
 
 		 1027 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 1025 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1029 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.87 
 
 		 1019 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1019 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1041 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.67 
 
 		 1046 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  32.49 
 
 		 1022 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1046 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.64 
 
 		 1039 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1044 aa  485  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1046 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1045 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1036 aa  476  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1053 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1046 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1040 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1041 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1054 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1012 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1067 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1047 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1024 aa  459  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1036 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1047 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1021 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1050 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1019 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1042 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1053 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1021 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1048 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 		 1047 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1047 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1048 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1022 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1048 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1059 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  30.64 
 
 		 1045 aa  452  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2689  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1026 aa  452  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1020 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.92 
 
 		 1025 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1049 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1051 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1050 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1049 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1019 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.2 
 
 		 1056 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1016 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1021 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1021 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.1 
 
 		 1056 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.1 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1060 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.1 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.63 
 
 		 1025 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  29.63 
 
 		 1041 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1071 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.35 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1033 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1056 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1057 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.6 
 
 		 1057 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1017 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  29.09 
 
 		 1019 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1017 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1089 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1019 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1031 aa  433  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  28.47 
 
 		 1025 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1021 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1013 aa  429  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1020 aa  429  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5212  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.22 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.6 
 
 		 1017 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  29.55 
 
 		 1024 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  29.94 
 
 		 1110 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1067 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  29.45 
 
 		 1024 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1025 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1021 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1047 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1020 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.19 
 
 		 1010 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1012 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1018 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  28.81 
 
 		 1015 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1018 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1049 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0808  RND family mulitdrug efflux protein  30.48 
 
 		 1037 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485603  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1045 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  28.81 
 
 		 1015 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>