More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1315 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.48 
 
 		 1027 aa  995    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  36.72 
 
 		 1018 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  37.65 
 
 		 1025 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  35.79 
 
 		 1027 aa  635    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2040    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  51.9 
 
 		 1022 aa  1023    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1019 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1015 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.33 
 
 		 1019 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.23 
 
 		 1012 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.17 
 
 		 1010 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.43 
 
 		 1032 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  33.1 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1013 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1021 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  32.14 
 
 		 1025 aa  515  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1029 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1029 aa  509  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1029 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1040 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1019 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1027 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1029 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1029 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1029 aa  502  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1029 aa  502  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1027 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1056 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1025 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  30.44 
 
 		 1019 aa  492  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1019 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1017 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1028 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1023 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1013 aa  489  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.96 
 
 		 1028 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1040 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1024 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1021 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1028 aa  479  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1017 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1024 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.08 
 
 		 1016 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1009 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1029 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 		 1053 aa  473  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1019 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1045 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1042 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.86 
 
 		 1045 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1050 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1057 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1054 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1046 aa  466  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1046 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1039 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.7 
 
 		 1039 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1046 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.14 
 
 		 1046 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1018 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1039 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  30.42 
 
 		 1020 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1044 aa  458  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1016 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1016 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1018 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1041 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  31.72 
 
 		 1017 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1024 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1047 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  30.6 
 
 		 1015 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  31.23 
 
 		 1025 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  29.22 
 
 		 1025 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1053 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1047 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  30.84 
 
 		 1022 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1048 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.56 
 
 		 1057 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.79 
 
 		 1014 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1048 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1021 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1041 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  30.74 
 
 		 1110 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1049 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1049 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1050 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.38 
 
 		 1028 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.24 
 
 		 1056 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1028 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1041 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1047 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1036 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1023 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1047 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.24 
 
 		 1056 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1022 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>