More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04840 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1018 aa  2016    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.76 
 
 		 1027 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1015 aa  799    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1022 aa  715    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  71.11 
 
 		 1027 aa  1507    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 		 1029 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.79 
 
 		 1025 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.67 
 
 		 1019 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1019 aa  535  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.88 
 
 		 1010 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1019 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1013 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1050 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.66 
 
 		 1046 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1046 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1044 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1012 aa  496  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1013 aa  492  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1041 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1048 aa  486  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1009 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1036 aa  482  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  31.24 
 
 		 1036 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1047 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1042 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1045 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  29.07 
 
 		 1019 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1053 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1040 aa  468  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1017 aa  465  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1019 aa  466  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1036 aa  466  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.59 
 
 		 1045 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1046 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 1017 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1040 aa  466  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.32 
 
 		 1017 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.9 
 
 		 1039 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.79 
 
 		 1032 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1056 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1021 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1019 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1048 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1046 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1017 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  30.33 
 
 		 1040 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 		 1033 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1033 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1012 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.85 
 
 		 1025 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1018 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  29.11 
 
 		 1025 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.63 
 
 		 1028 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1039 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.28 
 
 		 1036 aa  452  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1017 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1021 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1024 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1023 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1021 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1049 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1047 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.66 
 
 		 1025 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1049 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1047 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1048 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1021 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1025 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  30.71 
 
 		 1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1021 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  29.7 
 
 		 1020 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1023 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1035 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1054 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1035 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1021 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1047 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1029 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1021 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1050 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1020 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1024 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  30.57 
 
 		 1015 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1047 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5212  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  29.72 
 
 		 1025 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1059 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1020 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1024 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1029 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1029 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1020 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.18 
 
 		 1057 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1017 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  30.47 
 
 		 1015 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>