More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2636 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  87.56 
 
 		 1022 aa  1785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  83.71 
 
 		 1026 aa  1704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  88.06 
 
 		 1022 aa  1795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  87.96 
 
 		 1022 aa  1793    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  76.5 
 
 		 1026 aa  1526    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1029 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1025 aa  2058    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  72.83 
 
 		 1022 aa  1452    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.78 
 
 		 1039 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  77.1 
 
 		 1023 aa  1587    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 		 1037 aa  696    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  84.8 
 
 		 1026 aa  1729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  84.9 
 
 		 1026 aa  1729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  76.73 
 
 		 1030 aa  1536    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  77.87 
 
 		 1021 aa  1633    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  87.76 
 
 		 1022 aa  1793    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  73.25 
 
 		 1023 aa  1513    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1049 aa  710    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.28 
 
 		 1048 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  84.8 
 
 		 1026 aa  1731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  74.29 
 
 		 1038 aa  1500    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.51 
 
 		 830 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1019 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1008 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.76 
 
 		 1019 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1021 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1021 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1021 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1026 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  27.58 
 
 		 1019 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1020 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1012 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  26.65 
 
 		 1022 aa  363  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.36 
 
 		 1025 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1019 aa  362  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1035 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.5 
 
 		 1028 aa  361  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1021 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1022 aa  360  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1022 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1040 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.38 
 
 		 1025 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.2 
 
 		 1027 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  29.15 
 
 		 1025 aa  357  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1048 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1042 aa  354  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1044 aa  353  8e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  25.74 
 
 		 1045 aa  352  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1030 aa  351  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1050 aa  351  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1059 aa  351  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1054 aa  351  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1014 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1019 aa  349  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1049 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1049 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1047 aa  350  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1047 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.27 
 
 		 1010 aa  348  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1048 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1046 aa  347  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1057 aa  347  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1056 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1029 aa  343  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1024 aa  343  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1009 aa  343  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1024 aa  343  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1046 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1046 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1023 aa  341  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  25.73 
 
 		 1040 aa  337  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1036 aa  337  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1020 aa  335  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.53 
 
 		 1046 aa  335  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.39 
 
 		 1057 aa  334  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1041 aa  333  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1009 aa  333  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.91 
 
 		 1056 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.91 
 
 		 1056 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.91 
 
 		 1056 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1036 aa  332  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1039 aa  331  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1020 aa  330  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.91 
 
 		 1056 aa  330  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  25.07 
 
 		 1025 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1031 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1039 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1027 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1014 aa  328  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1033 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1046 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1046 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1029 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  26.38 
 
 		 1020 aa  327  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1046 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1053 aa  327  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  327  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1045 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>