More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1277 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  77.12 
 
 		 1022 aa  1584    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  76.77 
 
 		 1026 aa  1575    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  76.92 
 
 		 1022 aa  1582    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  76.91 
 
 		 1026 aa  1536    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1029 aa  792    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  76.92 
 
 		 1022 aa  1582    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  77.1 
 
 		 1025 aa  1567    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.14 
 
 		 1039 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  75.02 
 
 		 1038 aa  1499    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  76.98 
 
 		 1030 aa  1548    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1023 aa  2052    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  37.44 
 
 		 1037 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  78.59 
 
 		 1026 aa  1605    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.27 
 
 		 1048 aa  716    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  78.09 
 
 		 1026 aa  1596    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  83.6 
 
 		 1021 aa  1742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  74.05 
 
 		 1023 aa  1535    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.47 
 
 		 1049 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  78.39 
 
 		 1026 aa  1601    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  77.12 
 
 		 1022 aa  1585    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  73.52 
 
 		 1022 aa  1469    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.63 
 
 		 830 aa  596  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1019 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1008 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1019 aa  396  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.07 
 
 		 1019 aa  386  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1020 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.6 
 
 		 1027 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1014 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.3 
 
 		 1028 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.72 
 
 		 1019 aa  364  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1022 aa  360  8e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1035 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1026 aa  358  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1046 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1009 aa  354  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1046 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1024 aa  353  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1012 aa  352  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  27.83 
 
 		 1020 aa  350  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1021 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1021 aa  347  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1021 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1030 aa  346  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1023 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.43 
 
 		 1025 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1051 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1035 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1035 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1021 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1044 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1029 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1056 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  25.93 
 
 		 1022 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1046 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1045 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.67 
 
 		 1025 aa  335  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.3 
 
 		 1046 aa  334  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  27.19 
 
 		 1015 aa  334  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1019 aa  333  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.69 
 
 		 1027 aa  332  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  26.36 
 
 		 1025 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1029 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1041 aa  330  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1041 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.34 
 
 		 1010 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1053 aa  328  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1014 aa  328  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1009 aa  328  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1048 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1047 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1022 aa  327  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1057 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1031 aa  327  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1047 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  23.75 
 
 		 1040 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3321  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1021 aa  325  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  24.03 
 
 		 1048 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1028 aa  324  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1049 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1049 aa  323  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 1017 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1013 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.29 
 
 		 1056 aa  322  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1023 aa  322  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1014 aa  322  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1059 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1025 aa  320  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.88 
 
 		 1056 aa  320  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1020 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1035 aa  320  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.88 
 
 		 1056 aa  320  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1045 aa  319  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  26.8 
 
 		 1025 aa  319  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1020 aa  319  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1046 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1045 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  23.98 
 
 		 1050 aa  318  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1046 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1046 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>