More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1535 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  47.38 
 
 		 1026 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1014 aa  886    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  53.14 
 
 		 1026 aa  1066    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1030 aa  2055    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  46.97 
 
 		 1028 aa  920    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1020 aa  963    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.13 
 
 		 1024 aa  572  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1020 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1034 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1029 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1050 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1035 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1009 aa  399  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1053 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.27 
 
 		 1024 aa  396  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1043 aa  396  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1043 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1023 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1051 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1021 aa  386  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1029 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1092 aa  383  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1044 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1046 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1026 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1044 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.6 
 
 		 1026 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1026 aa  380  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1026 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1008 aa  380  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1058 aa  379  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1070 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1060 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1022 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1034 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1022 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1025 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.31 
 
 		 1036 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1095 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1022 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1022 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1058 aa  364  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  27.76 
 
 		 1019 aa  363  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1022 aa  363  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1071 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1041 aa  362  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1039 aa  360  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1023 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1034 aa  360  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.85 
 
 		 1053 aa  360  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1050 aa  359  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1048 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.93 
 
 		 1034 aa  357  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1038 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1059 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1055 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1040 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1058 aa  353  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1066 aa  353  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1057 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1044 aa  351  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.63 
 
 		 1054 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.21 
 
 		 1020 aa  351  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  29.21 
 
 		 1088 aa  351  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1030 aa  350  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1019 aa  350  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 1496 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1033 aa  349  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1191 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1041 aa  349  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1026 aa  349  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1023 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1042 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1046 aa  349  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  28.7 
 
 		 1041 aa  348  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.91 
 
 		 1028 aa  348  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.48 
 
 		 1069 aa  348  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1088 aa  347  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1143 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1038 aa  344  5e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1042 aa  343  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.82 
 
 		 1049 aa  343  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1039 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1033 aa  343  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1054 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1035 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1031 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1049 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1031 aa  342  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1039 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.41 
 
 		 1019 aa  340  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1054 aa  340  8e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1470 aa  340  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1017 aa  340  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>