More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4735 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.45 
 
 
1026 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  39.49 
 
 
1022 aa  773    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  38.72 
 
 
1030 aa  734    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1029 aa  2057    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  40.18 
 
 
1022 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 
1038 aa  738    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 
1039 aa  725    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  39.53 
 
 
1022 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  39.53 
 
 
1026 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 
1023 aa  791    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 
1022 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.22 
 
 
1048 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  47.38 
 
 
1037 aa  931    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 
1026 aa  777    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 
1026 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 
1021 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 
1025 aa  770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  39.35 
 
 
1023 aa  769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 
1049 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  39.49 
 
 
1022 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  39.63 
 
 
1026 aa  779    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  38.92 
 
 
830 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1019 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 
1056 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 
1020 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 
1041 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1019 aa  413  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 
1046 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 
1046 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 
1051 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28 
 
 
1019 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 
1059 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 
1046 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1045 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  29.25 
 
 
1019 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 
1036 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 
1036 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  29.71 
 
 
1025 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 
1035 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 
1041 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 
1035 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 
1014 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1023 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 
1044 aa  386  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  29.09 
 
 
1019 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.32 
 
 
1027 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1008 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  28.14 
 
 
1025 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 
1067 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 
1035 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 
1024 aa  379  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  26.48 
 
 
1046 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 
1053 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1039 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1035 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  27.75 
 
 
1039 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1039 aa  376  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 
1021 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 
1053 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 
1012 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.71 
 
 
1025 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  27.13 
 
 
1027 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 
1020 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.34 
 
 
1010 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 
1021 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.11 
 
 
1009 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.64 
 
 
1025 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  27.62 
 
 
1036 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1035 aa  366  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1021 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 
1037 aa  366  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 
1014 aa  366  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 
1021 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  27.71 
 
 
1036 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1009 aa  365  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 
1022 aa  364  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 
1024 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.83 
 
 
1028 aa  363  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 
1012 aa  363  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0998  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 
1027 aa  362  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.32 
 
 
1032 aa  362  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 
1051 aa  362  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 
1029 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1049 aa  362  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 
1029 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 
1049 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 
1049 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  26.73 
 
 
1020 aa  360  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 
1022 aa  360  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.08 
 
 
1017 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 
1054 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 
1048 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 
1048 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  28.02 
 
 
1015 aa  359  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 
1049 aa  358  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1047 aa  357  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 
1047 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 
1047 aa  357  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 
1050 aa  356  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 
1089 aa  355  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>