More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1311 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.08 
 
 		 1048 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.78 
 
 		 1026 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  41.29 
 
 		 1022 aa  763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 		 1022 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1029 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  40.88 
 
 		 1026 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  40.55 
 
 		 1023 aa  764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1030 aa  716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  40.81 
 
 		 1022 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1039 aa  2027    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  41 
 
 		 1022 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  40.08 
 
 		 1023 aa  738    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 		 1038 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  41.04 
 
 		 1026 aa  760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  40.78 
 
 		 1025 aa  750    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 		 1026 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  41.22 
 
 		 1021 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.16 
 
 		 1049 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 		 1022 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  57.13 
 
 		 830 aa  877    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  41.14 
 
 		 1026 aa  762    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1037 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1020 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1035 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1019 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1008 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.72 
 
 		 1027 aa  357  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1035 aa  350  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1035 aa  350  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.09 
 
 		 1019 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1036 aa  346  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1036 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1041 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.82 
 
 		 1019 aa  344  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  27.62 
 
 		 1022 aa  343  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.38 
 
 		 1033 aa  341  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1033 aa  341  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1019 aa  341  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1022 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1056 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1044 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 1017 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1041 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1071 aa  338  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1020 aa  338  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1037 aa  336  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1046 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1035 aa  336  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1047 aa  335  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1067 aa  334  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1035 aa  334  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1049 aa  334  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1031 aa  333  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1029 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1046 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1046 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1036 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1049 aa  332  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1046 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1051 aa  331  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  26.12 
 
 		 1046 aa  330  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1014 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1024 aa  330  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1051 aa  330  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1053 aa  328  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1012 aa  327  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1047 aa  327  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.16 
 
 		 1020 aa  326  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1026 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1035 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  25.8 
 
 		 1025 aa  325  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  26.45 
 
 		 1040 aa  325  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1046 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  26.57 
 
 		 1027 aa  324  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1059 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1045 aa  323  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  26.07 
 
 		 1036 aa  323  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1045 aa  323  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1045 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1071 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1048 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1030 aa  322  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  25.17 
 
 		 1020 aa  322  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1012 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1046 aa  321  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1021 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1014 aa  320  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1021 aa  320  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.11 
 
 		 1010 aa  320  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.46 
 
 		 1025 aa  318  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1089 aa  318  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5653  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1022 aa  318  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235963  hitchhiker  0.00278387 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1035 aa  318  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1060 aa  317  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3446  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1024 aa  317  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1039 aa  317  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1017 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1023 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1039 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>