More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3931 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1014 aa  869    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  46.31 
 
 		 1026 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1026 aa  2030    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  53.14 
 
 		 1030 aa  1036    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  49.11 
 
 		 1020 aa  899    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  43.52 
 
 		 1028 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.34 
 
 		 1024 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1034 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1035 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1092 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1029 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1043 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.75 
 
 		 1036 aa  396  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1050 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1043 aa  389  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1009 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1038 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1054 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1038 aa  386  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1191 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1054 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1053 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1028 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1051 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1054 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1021 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1039 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1041 aa  376  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1028 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1040 aa  376  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1046 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.66 
 
 		 1024 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1054 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.31 
 
 		 1019 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.58 
 
 		 1024 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1048 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1011 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1058 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1031 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1044 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1057 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1055 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1048 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1058 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1067 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.84 
 
 		 1033 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1039 aa  366  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1036 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1047 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.06 
 
 		 1050 aa  364  4e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1033 aa  363  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1044 aa  363  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1089 aa  362  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  27.47 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1058 aa  362  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1036 aa  362  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1049 aa  360  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  28.68 
 
 		 1041 aa  360  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1039 aa  360  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1049 aa  360  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1059 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 1496 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1051 aa  358  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.56 
 
 		 1036 aa  358  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1023 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1038 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1045 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1022 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1022 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1035 aa  356  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.17 
 
 		 1069 aa  356  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1074 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1022 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1015 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1022 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1045 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1041 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1044 aa  355  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1025 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1063 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  27.18 
 
 		 1039 aa  354  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1022 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1019 aa  354  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1023 aa  353  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1048 aa  353  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1009 aa  353  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1050 aa  352  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1057 aa  352  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1036 aa  352  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1042 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1032 aa  351  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1050 aa  351  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  27.96 
 
 		 1025 aa  351  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1039 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1021 aa  350  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1029 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>