More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1065 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.34 
 
 		 1048 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.94 
 
 		 1026 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  38.52 
 
 		 1026 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1029 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  39.21 
 
 		 1023 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  38.16 
 
 		 1039 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1022 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1025 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  38.47 
 
 		 1023 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  39.24 
 
 		 1022 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  39 
 
 		 1030 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  36.74 
 
 		 1037 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  39.4 
 
 		 1026 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  38.02 
 
 		 1038 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 		 1026 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1021 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1022 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1049 aa  2055    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  38.99 
 
 		 1022 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1026 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1022 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  38.8 
 
 		 830 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1008 aa  365  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1020 aa  357  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1019 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1023 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.46 
 
 		 1027 aa  328  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1019 aa  327  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.35 
 
 		 1019 aa  327  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.73 
 
 		 1019 aa  326  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1035 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1012 aa  321  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  26.22 
 
 		 1020 aa  321  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1014 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1036 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  26.22 
 
 		 1036 aa  315  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1026 aa  313  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1047 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1022 aa  313  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1035 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1035 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1048 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  26.02 
 
 		 1040 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1029 aa  308  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1009 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.36 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1035 aa  308  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1016 aa  307  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1030 aa  306  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1013 aa  305  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1050 aa  304  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  26.53 
 
 		 1015 aa  303  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1013 aa  303  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1035 aa  303  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1025 aa  302  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  25.37 
 
 		 1024 aa  301  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1020 aa  301  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1045 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1045 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  25.37 
 
 		 1024 aa  301  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1019 aa  301  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1043 aa  301  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  26.54 
 
 		 1025 aa  300  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1029 aa  300  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1046 aa  300  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1041 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5106  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1049 aa  299  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1046 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.1 
 
 		 1020 aa  298  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1046 aa  298  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1046 aa  298  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1029 aa  297  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1015 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1028 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1016 aa  296  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1009 aa  296  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2485  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1029 aa  295  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175334  normal  0.956638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1560  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1026 aa  295  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.701497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  25.27 
 
 		 1027 aa  294  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1029 aa  294  8e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1021 aa  293  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1019 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1040 aa  291  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1073 aa  290  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1020 aa  290  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1020 aa  290  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1012 aa  290  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1027 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5653  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1022 aa  290  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235963  hitchhiker  0.00278387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1029 aa  290  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3129  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1021 aa  289  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1033 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.43 
 
 		 1032 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1025 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1023 aa  288  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4856  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1023 aa  288  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287166  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1023 aa  288  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1028 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1016 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>