More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1002 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  44.82 
 
 		 1020 aa  875    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1028 aa  2073    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  53.09 
 
 		 1014 aa  1077    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  46.97 
 
 		 1030 aa  892    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  43.52 
 
 		 1026 aa  867    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  59.61 
 
 		 1026 aa  1139    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.82 
 
 		 1024 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1020 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1029 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1038 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1011 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1035 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1009 aa  416  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1034 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1044 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1046 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1045 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1043 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1046 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1092 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1046 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  27.43 
 
 		 1046 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.47 
 
 		 1033 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1041 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1191 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  27.37 
 
 		 1134 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1023 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1017 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1059 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1020 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1017 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1021 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1070 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1058 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1071 aa  373  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  27.17 
 
 		 1022 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1041 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.89 
 
 		 1025 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1095 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1044 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1031 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1059 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.71 
 
 		 1025 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1073 aa  365  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1053 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1021 aa  363  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1025 aa  363  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1067 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1058 aa  362  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.97 
 
 		 1024 aa  361  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1041 aa  361  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1048 aa  360  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1065 aa  360  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1053 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  26.8 
 
 		 1015 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  26.43 
 
 		 1015 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1039 aa  359  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1055 aa  358  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 1496 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.54 
 
 		 1017 aa  357  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1470 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1022 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1058 aa  356  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  26.44 
 
 		 1019 aa  354  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1067 aa  354  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1023 aa  354  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1008 aa  354  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.53 
 
 		 1024 aa  353  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1046 aa  353  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1024 aa  352  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1056 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.05 
 
 		 1028 aa  351  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1124 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1031 aa  350  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1036 aa  350  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1021 aa  350  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.69 
 
 		 1036 aa  350  9e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1057 aa  350  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1038 aa  350  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1017 aa  349  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1032 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  26.29 
 
 		 1025 aa  350  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  26.82 
 
 		 1025 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1021 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.56 
 
 		 1019 aa  348  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1047 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1016 aa  348  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1034 aa  347  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3465  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1074 aa  347  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1040 aa  347  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1051 aa  347  8e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1044 aa  347  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>