More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0507 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  46.09 
 
 		 1026 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1020 aa  2024    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  44.82 
 
 		 1028 aa  894    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  42.57 
 
 		 1014 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  49.11 
 
 		 1026 aa  920    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1030 aa  954    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.45 
 
 		 1024 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1020 aa  486  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1050 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1029 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1034 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1011 aa  442  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.18 
 
 		 1024 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1043 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1092 aa  416  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1041 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.83 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1059 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1044 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.91 
 
 		 1134 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1043 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1039 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1009 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1038 aa  386  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1046 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.5 
 
 		 1024 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1023 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1034 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1058 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1055 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1051 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1035 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.85 
 
 		 1050 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1053 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1049 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1058 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1063 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1048 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1071 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  27.49 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1044 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1040 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1044 aa  360  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1045 aa  360  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1040 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1191 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1057 aa  355  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1021 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.24 
 
 		 1049 aa  353  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1034 aa  352  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1017 aa  352  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1055 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1045 aa  352  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1024 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1074 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1068 aa  350  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1044 aa  350  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1033 aa  348  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1033 aa  348  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.36 
 
 		 1019 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1067 aa  348  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1041 aa  347  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1026 aa  347  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1049 aa  347  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1028 aa  347  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1041 aa  346  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1046 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1028 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1022 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1015 aa  346  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.03 
 
 		 1028 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1065 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1008 aa  344  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.9 
 
 		 1069 aa  344  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1009 aa  344  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1051 aa  344  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1064 aa  344  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1044 aa  343  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1046 aa  343  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1049 aa  343  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1042 aa  343  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  28.2 
 
 		 1088 aa  343  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1021 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1014 aa  343  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1088 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.14 
 
 		 1064 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1046 aa  342  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1088 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1047 aa  341  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1053 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  25.64 
 
 		 1019 aa  338  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1058 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1012 aa  338  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1046 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1056 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1021 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>