More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1118 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  49.4 
 
 		 1029 aa  1029    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 1009 aa  2007    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1020 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1012 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1035 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  28.95 
 
 		 1020 aa  438  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  30.45 
 
 		 1025 aa  439  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  29.96 
 
 		 1019 aa  438  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1014 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1036 aa  433  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1019 aa  432  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.56 
 
 		 1019 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1028 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1019 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1046 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1036 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.51 
 
 		 1028 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1021 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  29.22 
 
 		 1027 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1024 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1008 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1022 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1021 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.44 
 
 		 1016 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  29.53 
 
 		 1041 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  28.63 
 
 		 1036 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1021 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3129  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1021 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1035 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1035 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  27.85 
 
 		 1039 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  28.52 
 
 		 1040 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1045 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1046 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1040 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1036 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  27.25 
 
 		 1046 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1029 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.46 
 
 		 1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1029 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1024 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1021 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1046 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1047 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1027 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1021 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.02 
 
 		 1032 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1026 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1029 aa  406  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1048 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  27.6 
 
 		 1045 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1020 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1044 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1029 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1049 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  27.17 
 
 		 1025 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1050 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  28.85 
 
 		 1025 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1042 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1049 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1025 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1047 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1048 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.91 
 
 		 1010 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1040 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1050 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1029 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1047 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  28.75 
 
 		 1025 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1035 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1024 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1013 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.78 
 
 		 1036 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1048 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.45 
 
 		 1057 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1053 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1021 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1028 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1029 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1016 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1019 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1029 aa  396  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1059 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1020 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2689  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1026 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  28.2 
 
 		 1025 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1013 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1025 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1027 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1046 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.91 
 
 		 1056 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1026 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.91 
 
 		 1056 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.91 
 
 		 1056 aa  393  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 		 1009 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  27.26 
 
 		 1020 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>