More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6008 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  47.38 
 
 		 1030 aa  906    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  56.72 
 
 		 1014 aa  1155    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  46.09 
 
 		 1020 aa  875    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  46.31 
 
 		 1026 aa  908    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1026 aa  2051    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  59.61 
 
 		 1028 aa  1202    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.07 
 
 		 1024 aa  609  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1020 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1043 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1029 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1035 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1038 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1009 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1092 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1050 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1050 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1048 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1034 aa  393  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.09 
 
 		 1036 aa  389  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1053 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1047 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1059 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6001  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1037 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233388  normal  0.207677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4121  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1035 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1071 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1025 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1055 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1044 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0820  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.72 
 
 		 1036 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1033 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1049 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1021 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  27.12 
 
 		 1046 aa  376  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.58 
 
 		 1033 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  27.53 
 
 		 1019 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1046 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1023 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1058 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  27.92 
 
 		 1022 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3798  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1035 aa  369  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1034 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6138  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1019 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1299  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0428  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1035 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6531  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.57 
 
 		 1028 aa  370  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1560  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1026 aa  366  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.701497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1041 aa  366  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  26.38 
 
 		 1020 aa  366  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1044 aa  366  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3205  transmembrane drug efflux protein  27.14 
 
 		 1040 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.228213  normal  0.0965469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1191 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1046 aa  365  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1057 aa  363  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1045 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1041 aa  362  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2194  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1039 aa  361  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1048 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1045 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.62 
 
 		 1024 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1046 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1874  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1029 aa  358  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.722647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3139  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1029 aa  358  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.856751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1045 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1020 aa  357  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2423  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1030 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1031 aa  356  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3302  RND efflux transporter  27.3 
 
 		 1030 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186074  normal  0.0366541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1025 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1070 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2902  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1236 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1020 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1053 aa  355  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0998  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1027 aa  354  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1044 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1019 aa  353  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1027 aa  353  8.999999999999999e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1021 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  27.39 
 
 		 1015 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.62 
 
 		 1024 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1058 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.18 
 
 		 1050 aa  353  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  27.72 
 
 		 1015 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1023 aa  353  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1017 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1023 aa  352  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1042 aa  352  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1023 aa  352  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46590  putative AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.56 
 
 		 1029 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000144683  hitchhiker  0.00000801184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1280  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1037 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  26.3 
 
 		 1025 aa  351  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>