More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5032 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1024 aa  2066    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1014 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1028 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1026 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1020 aa  601  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  36.27 
 
 		 1026 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1030 aa  569  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1020 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1011 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1009 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1044 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1050 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1043 aa  365  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1044 aa  363  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1035 aa  357  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.41 
 
 		 1025 aa  357  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1092 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1046 aa  347  6e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1038 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1038 aa  343  9e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.63 
 
 		 1134 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.65 
 
 		 1049 aa  341  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1069 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.43 
 
 		 1024 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1014 aa  340  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1035 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  26.37 
 
 		 1042 aa  336  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1146 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1008 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  25.51 
 
 		 1025 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1034 aa  330  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.63 
 
 		 1019 aa  329  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1021 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1068 aa  328  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1031 aa  328  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  25.51 
 
 		 1025 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1021 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1034 aa  327  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1030 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1022 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1021 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.38 
 
 		 1024 aa  326  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1040 aa  327  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1044 aa  324  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  26 
 
 		 1034 aa  325  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1038 aa  325  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1019 aa  324  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1023 aa  324  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 1039 aa  323  9.000000000000001e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1036 aa  323  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  25.12 
 
 		 1019 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1024 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1021 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1033 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1046 aa  322  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1029 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1041 aa  320  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.29 
 
 		 1027 aa  320  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  23.97 
 
 		 1070 aa  320  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1013 aa  319  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1015 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  25.72 
 
 		 1027 aa  319  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1023 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1015 aa  317  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1143 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.22 
 
 		 1068 aa  316  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1019 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1034 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1083 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1038 aa  315  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1191 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  25.05 
 
 		 1025 aa  315  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1031 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.24 
 
 		 1032 aa  315  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1031 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  23.48 
 
 		 1071 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1082 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1044 aa  313  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.35 
 
 		 1026 aa  313  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  23.36 
 
 		 1095 aa  313  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1086 aa  313  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1041 aa  313  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  24.83 
 
 		 1036 aa  313  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1042 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1019 aa  313  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1024 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.54 
 
 		 1081 aa  312  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.29 
 
 		 1034 aa  313  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1027 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  24.05 
 
 		 1021 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1031 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1031 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2902  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1236 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1021 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>