More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01075 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  52.11 
 
 		 1015 aa  1022    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1025 aa  1048    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.2 
 
 		 1020 aa  1057    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  52.11 
 
 		 1015 aa  1024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  52.42 
 
 		 1027 aa  1069    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  52.66 
 
 		 1015 aa  1059    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1026 aa  2090    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  52.79 
 
 		 1030 aa  1072    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  52.11 
 
 		 1015 aa  1022    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  64.38 
 
 		 1040 aa  1289    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  52.41 
 
 		 1015 aa  1051    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  53.1 
 
 		 1018 aa  1048    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  52.85 
 
 		 1018 aa  1047    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  51.39 
 
 		 1021 aa  1033    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  52.08 
 
 		 1025 aa  1057    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  52.85 
 
 		 1018 aa  1035    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.29 
 
 		 1019 aa  1042    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  52.11 
 
 		 1015 aa  1022    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  39.72 
 
 		 1026 aa  778    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  37.91 
 
 		 823 aa  588  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1044 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1044 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1011 aa  446  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1050 aa  436  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1053 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1040 aa  419  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1470 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1034 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1034 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1046 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1023 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1044 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1043 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 1496 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1024 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1038 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1043 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1071 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1017 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.5 
 
 		 1024 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1006 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1058 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.37 
 
 		 1050 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1039 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1028 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1032 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1009 aa  369  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1065 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1041 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1014 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1028 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1042 aa  361  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1036 aa  361  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1050 aa  360  6e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1034 aa  360  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1058 aa  360  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1047 aa  360  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1058 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1041 aa  358  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1063 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1033 aa  355  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1027 aa  354  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.98 
 
 		 1049 aa  354  5.9999999999999994e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1101 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1031 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.89 
 
 		 1069 aa  353  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1055 aa  350  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1053 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1054 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1054 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1027 aa  346  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1070 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1041 aa  345  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1031 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1054 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1037 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  25.73 
 
 		 1038 aa  343  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1049 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1030 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.53 
 
 		 1064 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.39 
 
 		 1036 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1035 aa  338  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1048 aa  338  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1033 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  26.75 
 
 		 1028 aa  337  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1033 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1044 aa  337  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1074 aa  337  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1026 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1055 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1028 aa  334  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1044 aa  333  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1022 aa  333  9e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1018 aa  333  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1046 aa  333  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.17 
 
 		 1040 aa  332  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>