More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2194 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1026 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  75.24 
 
 		 1020 aa  1598    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  75.02 
 
 		 1015 aa  1597    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  76.64 
 
 		 1015 aa  1572    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  75.56 
 
 		 1027 aa  1622    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  76.64 
 
 		 1015 aa  1572    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.79 
 
 		 1026 aa  1053    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  76.64 
 
 		 1015 aa  1572    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1030 aa  2089    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  52.15 
 
 		 1040 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  75.12 
 
 		 1025 aa  1611    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  77.13 
 
 		 1018 aa  1605    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  76.83 
 
 		 1018 aa  1599    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  80.63 
 
 		 1021 aa  1709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  77.03 
 
 		 1018 aa  1583    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  77.03 
 
 		 1015 aa  1622    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  71.64 
 
 		 1019 aa  1529    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  75.68 
 
 		 1025 aa  1620    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  76.64 
 
 		 1015 aa  1572    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  36.57 
 
 		 823 aa  525  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1011 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1046 aa  399  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1024 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1071 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1053 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1050 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1043 aa  376  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1032 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1470 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1044 aa  364  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.24 
 
 		 1024 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 1496 aa  362  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1034 aa  362  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1034 aa  360  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1040 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1036 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1009 aa  357  6.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1014 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1044 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1038 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1027 aa  350  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1017 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1041 aa  345  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1039 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1058 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1022 aa  341  5e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1045 aa  340  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1023 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.05 
 
 		 1069 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1038 aa  334  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1044 aa  334  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1028 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1043 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.47 
 
 		 1036 aa  330  7e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1034 aa  330  9e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1058 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1050 aa  328  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1006 aa  327  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1041 aa  325  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1028 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1027 aa  325  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1054 aa  324  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1033 aa  324  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1063 aa  323  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1058 aa  323  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1054 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1075 aa  320  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1041 aa  320  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.51 
 
 		 1050 aa  320  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1028 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1173 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1054 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1101 aa  317  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1059 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1041 aa  317  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 		 1049 aa  315  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1095 aa  316  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1055 aa  316  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1026 aa  315  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1015 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1053 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1070 aa  313  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1072 aa  312  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1055 aa  311  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1040 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1043 aa  308  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1048 aa  308  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1048 aa  307  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1062 aa  306  9.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1067 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1016 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1049 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1027 aa  306  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1042 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.14 
 
 		 1040 aa  302  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.13 
 
 		 1014 aa  303  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.34 
 
 		 1030 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1042 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>