More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1419 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  74.23 
 
 		 1015 aa  1527    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  72.68 
 
 		 1027 aa  1552    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  73.01 
 
 		 1020 aa  1543    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  40.2 
 
 		 1026 aa  722    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  71.65 
 
 		 1025 aa  1528    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  71.9 
 
 		 1025 aa  1541    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  74.04 
 
 		 1015 aa  1522    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  71.64 
 
 		 1030 aa  1529    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.29 
 
 		 1026 aa  1025    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  50.49 
 
 		 1040 aa  998    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  73.82 
 
 		 1018 aa  1530    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  73.82 
 
 		 1018 aa  1528    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  73.53 
 
 		 1021 aa  1559    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  73.82 
 
 		 1018 aa  1511    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1019 aa  2082    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  74.23 
 
 		 1015 aa  1527    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  73.35 
 
 		 1015 aa  1556    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  74.23 
 
 		 1015 aa  1527    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  73.35 
 
 		 1015 aa  1545    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  37.48 
 
 		 823 aa  526  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1011 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1053 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1024 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1043 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1038 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1034 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1040 aa  389  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1044 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1046 aa  382  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1038 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.65 
 
 		 1024 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1058 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1034 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1009 aa  362  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1027 aa  361  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1043 aa  360  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1044 aa  360  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1017 aa  357  8.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1071 aa  356  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1006 aa  351  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1039 aa  348  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1032 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1038 aa  341  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1039 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1045 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1022 aa  340  7e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1034 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1058 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1044 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1101 aa  337  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1036 aa  337  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1065 aa  337  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.63 
 
 		 1050 aa  336  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  26.26 
 
 		 1030 aa  337  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1047 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 1496 aa  335  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1027 aa  333  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1058 aa  333  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1050 aa  333  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1059 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1026 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.53 
 
 		 1064 aa  332  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1014 aa  331  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1028 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1049 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1041 aa  329  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1055 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1067 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1063 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1053 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1015 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1043 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.91 
 
 		 1069 aa  325  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1028 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1048 aa  325  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2523  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1035 aa  324  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1041 aa  323  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1041 aa  320  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1171 aa  320  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1470 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.62 
 
 		 1036 aa  318  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1177 aa  317  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1075 aa  316  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1044 aa  317  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1048 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1033 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1074 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1044 aa  315  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  25.62 
 
 		 1026 aa  314  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1030 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1031 aa  312  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1054 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1191 aa  311  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1041 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1040 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 		 1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1054 aa  308  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1054 aa  307  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>