More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2510 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  39.49 
 
 		 1024 aa  782    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.73 
 
 		 1052 aa  1015    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  46.71 
 
 		 1034 aa  911    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  56.51 
 
 		 1048 aa  1079    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  35.89 
 
 		 1038 aa  718    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  48.49 
 
 		 1069 aa  1001    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  47.35 
 
 		 1038 aa  916    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  45.24 
 
 		 1039 aa  883    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.61 
 
 		 1025 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.96 
 
 		 1032 aa  724    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1068 aa  922    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  48.05 
 
 		 1045 aa  954    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  45.04 
 
 		 1057 aa  885    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  53.85 
 
 		 1041 aa  1034    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  46.86 
 
 		 1044 aa  902    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  45.33 
 
 		 1042 aa  927    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  41.69 
 
 		 1067 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1033 aa  2046    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  37.99 
 
 		 1043 aa  619  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1092 aa  587  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1146 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  44.38 
 
 		 1267 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1189 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  28.89 
 
 		 1165 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1050 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  42.69 
 
 		 1335 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1011 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1044 aa  356  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1470 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1038 aa  338  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1050 aa  337  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1043 aa  335  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1039 aa  335  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1020 aa  334  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1028 aa  333  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1034 aa  333  8e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1074 aa  332  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1033 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.2 
 
 		 1024 aa  327  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1032 aa  327  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 1496 aa  324  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1027 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1028 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1040 aa  319  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1020 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1044 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1022 aa  313  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1041 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1048 aa  312  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1034 aa  311  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1071 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.93 
 
 		 1049 aa  309  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1014 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  24.75 
 
 		 1006 aa  308  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.39 
 
 		 1024 aa  307  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  26.69 
 
 		 1035 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1029 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1028 aa  304  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1017 aa  303  8.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1036 aa  301  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1030 aa  300  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1033 aa  299  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1025 aa  299  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.15 
 
 		 1067 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1290 aa  296  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1031 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.45 
 
 		 1052 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1064 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1043 aa  296  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1065 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1046 aa  294  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.76 
 
 		 1036 aa  294  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1031 aa  292  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1029 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1034 aa  292  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1035 aa  291  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1028 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1031 aa  290  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1063 aa  290  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  290  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  290  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1034 aa  290  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.47 
 
 		 1031 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.25 
 
 		 1034 aa  290  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1101 aa  290  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1026 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1031 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1026 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1023 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1054 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1031 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1058 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1031 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1031 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1009 aa  287  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  29.38 
 
 		 1077 aa  286  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1054 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1044 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1045 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>