More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3537 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  50.74 
 
 		 1025 aa  976    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1025 aa  2026    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1035 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1033 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1043 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1030 aa  386  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1092 aa  376  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1470 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1050 aa  363  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1032 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.48 
 
 		 1049 aa  358  1.9999999999999998e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1020 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1041 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.73 
 
 		 1496 aa  353  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1036 aa  353  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1011 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1563  cation/multidrug efflux pump-like  29.84 
 
 		 1055 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.974109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1050 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1054 aa  351  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1038 aa  350  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1033 aa  349  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1035 aa  349  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1036 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1074 aa  347  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1067 aa  347  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1043 aa  347  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1067 aa  346  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1067 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.37 
 
 		 1067 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.46 
 
 		 1036 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1030 aa  339  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1023 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1034 aa  338  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1032 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1053 aa  337  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.07 
 
 		 1052 aa  335  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1044 aa  334  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1063 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1191 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1063 aa  333  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1048 aa  333  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1063 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1121 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1063 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1039 aa  330  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.87 
 
 		 1024 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1033 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1063 aa  326  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1040 aa  324  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1028 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1034 aa  322  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  24.54 
 
 		 1165 aa  321  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1009 aa  320  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1038 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1055 aa  320  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1050 aa  320  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1068 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1009 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1035 aa  318  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1038 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1041 aa  315  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1028 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1041 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.23 
 
 		 1034 aa  314  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1053 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1146 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1045 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1063 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.72 
 
 		 1067 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1055 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1064 aa  311  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1053 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1124 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1046 aa  310  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  28.24 
 
 		 1025 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1065 aa  308  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  27.03 
 
 		 1042 aa  307  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1044 aa  307  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1044 aa  307  8.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1030 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1043 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  26.28 
 
 		 1044 aa  304  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1069 aa  304  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  26.01 
 
 		 1039 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1017 aa  303  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.35 
 
 		 1069 aa  303  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1028 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1049 aa  302  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1048 aa  301  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1029 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.48 
 
 		 1057 aa  301  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1054 aa  301  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1066 aa  300  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  27.76 
 
 		 1048 aa  299  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1069 aa  299  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1057 aa  299  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1031 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1041 aa  297  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>