More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06541 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  68.21 
 
 		 1035 aa  1432    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  100 
 
 		 1033 aa  2092    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  61.87 
 
 		 1041 aa  1343    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  79.86 
 
 		 1034 aa  1677    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  61.37 
 
 		 1063 aa  1305    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1035 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 		 1033 aa  923    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  68.34 
 
 		 1036 aa  1420    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  65.34 
 
 		 1041 aa  1404    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  41.58 
 
 		 1030 aa  797    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.91 
 
 		 1052 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1048 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1063 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1067 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1067 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1067 aa  569  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1063 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.91 
 
 		 1067 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1063 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1063 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1053 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1049 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.95 
 
 		 1067 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  31.79 
 
 		 1044 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1055 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1121 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1032 aa  545  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.14 
 
 		 1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1050 aa  529  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1040 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1054 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1074 aa  519  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1054 aa  516  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  31.72 
 
 		 1039 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1043 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  29.63 
 
 		 1071 aa  495  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1048 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.93 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1051 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1069 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1038 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  29.5 
 
 		 1042 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1034 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.2 
 
 		 1048 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1053 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1050 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.4 
 
 		 1056 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1052 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1053 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.69 
 
 		 1075 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.32 
 
 		 1093 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1060 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.03 
 
 		 1074 aa  466  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1060 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1073 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1057 aa  458  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.42 
 
 		 1054 aa  456  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1060 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1061 aa  452  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1068 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1062 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1064 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1098 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.09 
 
 		 1060 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1066 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1035 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1072 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.8 
 
 		 1053 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1030 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1131 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  29.23 
 
 		 1135 aa  366  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1044 aa  354  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1137 aa  344  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1025 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1050 aa  338  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1034 aa  337  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1056 aa  332  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1044 aa  327  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1044 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1043 aa  321  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1057 aa  320  9e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1039 aa  319  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.29 
 
 		 1036 aa  318  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1038 aa  317  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1028 aa  317  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1051 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1043 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.52 
 
 		 1011 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1028 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.72 
 
 		 1050 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1055 aa  308  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1064 aa  307  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1039 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1028 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1046 aa  303  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  24.69 
 
 		 1069 aa  303  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>