More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3597 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.34 
 
 		 1067 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1063 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1063 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1063 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  50.62 
 
 		 1066 aa  1040    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  38.39 
 
 		 1044 aa  675    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  37.97 
 
 		 1063 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  38.7 
 
 		 1048 aa  678    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1060 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  37.12 
 
 		 1055 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  63.74 
 
 		 1062 aa  1378    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1068 aa  2168    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  37.34 
 
 		 1067 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1049 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1067 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 		 1050 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  35.4 
 
 		 1061 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  62.04 
 
 		 1053 aa  1340    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1063 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  37.34 
 
 		 1067 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.41 
 
 		 1067 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  36.93 
 
 		 1053 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1060 aa  630  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.94 
 
 		 1093 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 		 1057 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1073 aa  622  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.68 
 
 		 1041 aa  618  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.87 
 
 		 1074 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1121 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.31 
 
 		 1052 aa  602  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 		 1060 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  33.53 
 
 		 1056 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  35.02 
 
 		 1039 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1069 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1052 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  34.31 
 
 		 1051 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  32.52 
 
 		 1050 aa  552  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32.16 
 
 		 1042 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.64 
 
 		 1075 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1053 aa  499  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.18 
 
 		 1071 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1048 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1074 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.12 
 
 		 1048 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1054 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1072 aa  475  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1040 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1050 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1098 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1054 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1041 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29.39 
 
 		 1053 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1053 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1041 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1043 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.85 
 
 		 1060 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1064 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.77 
 
 		 1054 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1030 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1033 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1033 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1036 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1033 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.74 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1041 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1035 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1063 aa  363  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  29.47 
 
 		 1135 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1131 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1137 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1050 aa  283  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1056 aa  282  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1064 aa  271  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1030 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1034 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1031 aa  267  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1042 aa  265  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  23.77 
 
 		 1032 aa  264  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1057 aa  261  6e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 1496 aa  260  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1043 aa  260  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1041 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1025 aa  258  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1057 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  22.78 
 
 		 1044 aa  255  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1055 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1043 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.05 
 
 		 1034 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.47 
 
 		 1046 aa  252  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1470 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1028 aa  250  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 		 1036 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1042 aa  248  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 1036 aa  247  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  23.55 
 
 		 1040 aa  247  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  23.99 
 
 		 1038 aa  247  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>